Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAGPQ0VAQ4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAGPQ0VAQ4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMAGPQ0VAQ4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAGPQ0VAQ4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAGPQ0VAQ4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAGPQ0VAQ4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAGPQ0VAQ4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAGPQ0VAQ4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAGPQ0VAQ4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAGPQ0VAQ4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAGPQ0VAQ4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAGPQ0VAQ4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAGPQ0VAQ4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAGPQ0VAQ4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAGPQ0VAQ4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAGPQ0VAQ4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMAGPQ0VAQ4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMAGPQ0VAQ4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMAGPQ0VAQ4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAGPQ0VAQ4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMAGPQ0VAQ4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMAGPQ0VAQ4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAGPQ0VAQ4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMAGPQ0VAQ4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMAGPQ0VAQ4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAGPQ0VAQ4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAGPQ0VAQ4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMAGPQ0VAQ4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAGPQ0VAQ4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAGPQ0VAQ4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAGPQ0VAQ4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAGPQ0VAQ4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAGPQ0VAQ4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAGPQ0VAQ4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAGPQ0VAQ4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAGPQ0VAQ4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAGPQ0VAQ4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAGPQ0VAQ4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAGPQ0VAQ4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAGPQ0VAQ4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAGPQ0VAQ4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAGPQ0VAQ4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAGPQ0VAQ4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAGPQ0VAQ4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAGPQ0VAQ4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAGPQ0VAQ4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAGPQ0VAQ4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAGPQ0VAQ4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAGPQ0VAQ4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAGPQ0VAQ4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAGPQ0VAQ4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAGPQ0VAQ4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMAGPQ0VAQ4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAGPQ0VAQ4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAGPQ0VAQ4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAGPQ0VAQ4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAGPQ0VAQ4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAGPQ0VAQ4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMAGPQ0VAQ4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAGPQ0VAQ4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAGPQ0VAQ4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAGPQ0VAQ4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAGPQ0VAQ4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAGPQ0VAQ4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMAGPQ0VAQ4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAGPQ0VAQ4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAGPQ0VAQ4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAGPQ0VAQ4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAGPQ0VAQ4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAGPQ0VAQ4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAGPQ0VAQ4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAGPQ0VAQ4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMAGPQ0VAQ4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMAGPQ0VAQ4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMAGPQ0VAQ4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMAGPQ0VAQ4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMAGPQ0VAQ4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMAGPQ0VAQ4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMAGPQ0VAQ4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMAGPQ0VAQ4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMAGPQ0VAQ4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMAGPQ0VAQ4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMAGPQ0VAQ4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMAGPQ0VAQ4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAGPQ0VAQ4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAGPQ0VAQ4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMAGPQ0VAQ4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAGPQ0VAQ4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAGPQ0VAQ4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMAGPQ0VAQ4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMAGPQ0VAQ4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMAGPQ0VAQ4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAGPQ0VAQ4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAGPQ0VAQ4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAGPQ0VAQ4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.74
SMAGPQ0VAQ4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMAGPQ0VAQ4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAGPQ0VAQ4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAGPQ0VAQ4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms