Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
LMOD3Q0VAK6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
LMOD3Q0VAK6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
LMOD3Q0VAK6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
LMOD3Q0VAK6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
LMOD3Q0VAK6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
LMOD3Q0VAK6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
LMOD3Q0VAK6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
LMOD3Q0VAK6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
LMOD3Q0VAK6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
LMOD3Q0VAK6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
LMOD3Q0VAK6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
LMOD3Q0VAK6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
LMOD3Q0VAK6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
LMOD3Q0VAK6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
LMOD3Q0VAK6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
LMOD3Q0VAK6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
LMOD3Q0VAK6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
LMOD3Q0VAK6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
LMOD3Q0VAK6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
LMOD3Q0VAK6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
LMOD3Q0VAK6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
LMOD3Q0VAK6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
LMOD3Q0VAK6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
LMOD3Q0VAK6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
LMOD3Q0VAK6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
LMOD3Q0VAK6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
LMOD3Q0VAK6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
LMOD3Q0VAK6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
LMOD3Q0VAK6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
LMOD3Q0VAK6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
LMOD3Q0VAK6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
LMOD3Q0VAK6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
LMOD3Q0VAK6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
LMOD3Q0VAK6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
LMOD3Q0VAK6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
LMOD3Q0VAK6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
LMOD3Q0VAK6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
LMOD3Q0VAK6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
LMOD3Q0VAK6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
LMOD3Q0VAK6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
LMOD3Q0VAK6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
LMOD3Q0VAK6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
LMOD3Q0VAK6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
LMOD3Q0VAK6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
LMOD3Q0VAK6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
LMOD3Q0VAK6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
LMOD3Q0VAK6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
LMOD3Q0VAK6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
LMOD3Q0VAK6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
LMOD3Q0VAK6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
LMOD3Q0VAK6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
LMOD3Q0VAK6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
LMOD3Q0VAK6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
LMOD3Q0VAK6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
LMOD3Q0VAK6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
LMOD3Q0VAK6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
LMOD3Q0VAK6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
LMOD3Q0VAK6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
LMOD3Q0VAK6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
LMOD3Q0VAK6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
LMOD3Q0VAK6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
LMOD3Q0VAK6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
LMOD3Q0VAK6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
LMOD3Q0VAK6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
LMOD3Q0VAK6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
LMOD3Q0VAK6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
LMOD3Q0VAK6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LMOD3Q0VAK6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
LMOD3Q0VAK6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
LMOD3Q0VAK6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
LMOD3Q0VAK6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
LMOD3Q0VAK6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
LMOD3Q0VAK6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
LMOD3Q0VAK6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
LMOD3Q0VAK6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
LMOD3Q0VAK6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
LMOD3Q0VAK6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
LMOD3Q0VAK6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
LMOD3Q0VAK6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
LMOD3Q0VAK6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
LMOD3Q0VAK6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
LMOD3Q0VAK6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
LMOD3Q0VAK6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
LMOD3Q0VAK6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
LMOD3Q0VAK6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LMOD3Q0VAK6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
LMOD3Q0VAK6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
LMOD3Q0VAK6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
LMOD3Q0VAK6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
LMOD3Q0VAK6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
LMOD3Q0VAK6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
LMOD3Q0VAK6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.61■■■■□ 3.45
LMOD3Q0VAK6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
LMOD3Q0VAK6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
LMOD3Q0VAK6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
LMOD3Q0VAK6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
LMOD3Q0VAK6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
LMOD3Q0VAK6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
LMOD3Q0VAK6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms