Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ACTN3Q08043 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACTN3Q08043 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ACTN3Q08043 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ACTN3Q08043 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ACTN3Q08043 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ACTN3Q08043 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ACTN3Q08043 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ACTN3Q08043 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACTN3Q08043 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACTN3Q08043 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACTN3Q08043 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACTN3Q08043 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ACTN3Q08043 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ACTN3Q08043 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACTN3Q08043 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ACTN3Q08043 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ACTN3Q08043 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ACTN3Q08043 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ACTN3Q08043 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ACTN3Q08043 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ACTN3Q08043 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ACTN3Q08043 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ACTN3Q08043 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ACTN3Q08043 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ACTN3Q08043 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ACTN3Q08043 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ACTN3Q08043 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ACTN3Q08043 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ACTN3Q08043 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ACTN3Q08043 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ACTN3Q08043 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ACTN3Q08043 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACTN3Q08043 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACTN3Q08043 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ACTN3Q08043 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ACTN3Q08043 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACTN3Q08043 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACTN3Q08043 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ACTN3Q08043 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ACTN3Q08043 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ACTN3Q08043 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACTN3Q08043 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACTN3Q08043 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ACTN3Q08043 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ACTN3Q08043 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACTN3Q08043 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ACTN3Q08043 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ACTN3Q08043 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACTN3Q08043 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACTN3Q08043 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACTN3Q08043 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ACTN3Q08043 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACTN3Q08043 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACTN3Q08043 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACTN3Q08043 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACTN3Q08043 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACTN3Q08043 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ACTN3Q08043 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACTN3Q08043 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACTN3Q08043 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACTN3Q08043 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACTN3Q08043 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACTN3Q08043 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ACTN3Q08043 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ACTN3Q08043 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACTN3Q08043 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACTN3Q08043 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACTN3Q08043 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACTN3Q08043 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACTN3Q08043 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACTN3Q08043 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACTN3Q08043 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACTN3Q08043 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACTN3Q08043 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACTN3Q08043 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACTN3Q08043 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACTN3Q08043 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACTN3Q08043 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACTN3Q08043 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACTN3Q08043 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACTN3Q08043 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACTN3Q08043 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACTN3Q08043 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACTN3Q08043 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACTN3Q08043 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ACTN3Q08043 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ACTN3Q08043 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ACTN3Q08043 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACTN3Q08043 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ACTN3Q08043 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ACTN3Q08043 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACTN3Q08043 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACTN3Q08043 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACTN3Q08043 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACTN3Q08043 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACTN3Q08043 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ACTN3Q08043 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ACTN3Q08043 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACTN3Q08043 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms