Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRP1Q07954 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRP1Q07954 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRP1Q07954 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRP1Q07954 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP1Q07954 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LRP1Q07954 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP1Q07954 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP1Q07954 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRP1Q07954 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LRP1Q07954 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRP1Q07954 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRP1Q07954 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRP1Q07954 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRP1Q07954 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP1Q07954 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP1Q07954 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP1Q07954 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP1Q07954 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP1Q07954 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP1Q07954 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP1Q07954 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP1Q07954 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP1Q07954 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP1Q07954 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP1Q07954 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP1Q07954 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP1Q07954 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP1Q07954 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP1Q07954 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRP1Q07954 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRP1Q07954 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP1Q07954 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP1Q07954 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP1Q07954 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRP1Q07954 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRP1Q07954 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRP1Q07954 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP1Q07954 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP1Q07954 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP1Q07954 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRP1Q07954 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRP1Q07954 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRP1Q07954 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRP1Q07954 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRP1Q07954 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRP1Q07954 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LRP1Q07954 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRP1Q07954 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRP1Q07954 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP1Q07954 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP1Q07954 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRP1Q07954 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRP1Q07954 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRP1Q07954 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP1Q07954 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRP1Q07954 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRP1Q07954 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRP1Q07954 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRP1Q07954 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRP1Q07954 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRP1Q07954 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LRP1Q07954 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRP1Q07954 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRP1Q07954 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRP1Q07954 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LRP1Q07954 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRP1Q07954 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRP1Q07954 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRP1Q07954 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LRP1Q07954 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRP1Q07954 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP1Q07954 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP1Q07954 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRP1Q07954 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP1Q07954 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP1Q07954 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP1Q07954 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRP1Q07954 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRP1Q07954 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LRP1Q07954 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LRP1Q07954 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRP1Q07954 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRP1Q07954 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRP1Q07954 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LRP1Q07954 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRP1Q07954 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRP1Q07954 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP1Q07954 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP1Q07954 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRP1Q07954 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRP1Q07954 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRP1Q07954 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LRP1Q07954 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRP1Q07954 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRP1Q07954 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LRP1Q07954 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRP1Q07954 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRP1Q07954 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRP1Q07954 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms