Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 YMR090WYMR090W 684 nt12.28□□□□□ -0.44
HDA3Q06623 YDL221WYDL221W 552 nt12.27□□□□□ -0.45
HDA3Q06623 BDF1YLR399C 2061 nt12.25□□□□□ -0.45
HDA3Q06623 CSM2YIL132C 642 nt12.25□□□□□ -0.45
HDA3Q06623 YBR220CYBR220C 1683 nt12.23□□□□□ -0.45
HDA3Q06623 ART5YGR068C 1761 nt12.16□□□□□ -0.46
HDA3Q06623 YOR139CYOR139C 393 nt12.16□□□□□ -0.46
HDA3Q06623 SDH1YKL148C 1923 nt12.15□□□□□ -0.46
HDA3Q06623 IRC15YPL017C 1500 nt12.14□□□□□ -0.47
HDA3Q06623 GFD2YCL036W 1701 nt12.14□□□□□ -0.47
HDA3Q06623 NPL3YDR432W 1245 nt12.12□□□□□ -0.47
HDA3Q06623 TAT1YBR069C 1860 nt12.09□□□□□ -0.47
HDA3Q06623 GIS3YLR094C 1509 nt12.06□□□□□ -0.48
HDA3Q06623 PET9YBL030C 957 nt12.06□□□□□ -0.48
HDA3Q06623 TIR4YOR009W 1464 nt12.06□□□□□ -0.48
HDA3Q06623 RTS2YOR077W 699 nt12.05□□□□□ -0.48
HDA3Q06623 SCC4YER147C 1875 nt12.05□□□□□ -0.48
HDA3Q06623 YOL037CYOL037C 354 nt12.02□□□□□ -0.49
HDA3Q06623 YCH1YGR203W 447 nt12□□□□□ -0.49
HDA3Q06623 YMR057CYMR057C 372 nt11.96□□□□□ -0.49
HDA3Q06623 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.94□□□□□ -0.5
HDA3Q06623 YJL152WYJL152W 360 nt11.92□□□□□ -0.5
HDA3Q06623 PAU21YOR394W 495 nt11.92□□□□□ -0.5
HDA3Q06623 PAU22YPL282C 495 nt11.92□□□□□ -0.5
HDA3Q06623 CUE1YMR264W 612 nt11.9□□□□□ -0.5
HDA3Q06623 FPS1YLL043W 2010 nt11.83□□□□□ -0.52
HDA3Q06623 WHI5YOR083W 888 nt11.81□□□□□ -0.52
HDA3Q06623 YSC84YHR016C 1407 nt11.8□□□□□ -0.52
HDA3Q06623 SEC11YIR022W 504 nt11.79□□□□□ -0.52
HDA3Q06623 YLR281CYLR281C 468 nt11.79□□□□□ -0.52
HDA3Q06623 ARO7YPR060C 771 nt11.79□□□□□ -0.52
HDA3Q06623 PCH2YBR186W 1695 nt11.78□□□□□ -0.52
HDA3Q06623 YIL100WYIL100W 354 nt11.76□□□□□ -0.53
HDA3Q06623 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.76□□□□□ -0.53
HDA3Q06623 RRT12YCR045C 1476 nt11.74□□□□□ -0.53
HDA3Q06623 YHL050CYHL050C 2094 nt11.72□□□□□ -0.53
HDA3Q06623 GUT2YIL155C 1950 nt11.72□□□□□ -0.53
HDA3Q06623 YLR236CYLR236C 324 nt11.72□□□□□ -0.53
HDA3Q06623 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.7□□□□□ -0.54
HDA3Q06623 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.7□□□□□ -0.54
HDA3Q06623 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.7□□□□□ -0.54
HDA3Q06623 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.7□□□□□ -0.54
HDA3Q06623 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.7□□□□□ -0.54
HDA3Q06623 YNL195CYNL195C 786 nt11.68□□□□□ -0.54
HDA3Q06623 PUS2YGL063W 1113 nt11.61□□□□□ -0.55
HDA3Q06623 IDH1YNL037C 1083 nt11.6□□□□□ -0.55
HDA3Q06623 GBP2YCL011C 1284 nt11.56□□□□□ -0.56
HDA3Q06623 PAC11YDR488C 1602 nt11.55□□□□□ -0.56
HDA3Q06623 PIB2YGL023C 1908 nt11.54□□□□□ -0.56
HDA3Q06623 RRD1YIL153W 1182 nt11.53□□□□□ -0.56
HDA3Q06623 YJL225CYJL225C 5277 nt11.53□□□□□ -0.56
HDA3Q06623 DSK2YMR276W 1122 nt11.52□□□□□ -0.57
HDA3Q06623 RTF1YGL244W 1677 nt11.5□□□□□ -0.57
HDA3Q06623 IMP2'YIL154C 1041 nt11.5□□□□□ -0.57
HDA3Q06623 YPR011CYPR011C 981 nt11.49□□□□□ -0.57
HDA3Q06623 TCD2YKL027W 1344 nt11.46□□□□□ -0.57
HDA3Q06623 MET8YBR213W 825 nt11.46□□□□□ -0.57
HDA3Q06623 DED1YOR204W 1815 nt11.46□□□□□ -0.58
HDA3Q06623 BOP3YNL042W 1191 nt11.45□□□□□ -0.58
HDA3Q06623 NVJ2YPR091C 2313 nt11.43□□□□□ -0.58
HDA3Q06623 YDR433WYDR433W 441 nt11.42□□□□□ -0.58
HDA3Q06623 REG2YBR050C 1017 nt11.41□□□□□ -0.58
HDA3Q06623 FMT1YBL013W 1206 nt11.4□□□□□ -0.58
HDA3Q06623 FMP45YDL222C 930 nt11.39□□□□□ -0.59
HDA3Q06623 MXR2YCL033C 507 nt11.39□□□□□ -0.59
HDA3Q06623 FMP52YER004W 696 nt11.38□□□□□ -0.59
HDA3Q06623 NCP1YHR042W 2076 nt11.37□□□□□ -0.59
HDA3Q06623 CLB6YGR109C 1143 nt11.35□□□□□ -0.59
HDA3Q06623 LPX1YOR084W 1164 nt11.34□□□□□ -0.59
HDA3Q06623 PTK1YKL198C 1989 nt11.34□□□□□ -0.59
HDA3Q06623 LCB1YMR296C 1677 nt11.33□□□□□ -0.6
HDA3Q06623 PCM1YEL058W 1674 nt11.33□□□□□ -0.6
HDA3Q06623 ERV46YAL042W 1248 nt11.31□□□□□ -0.6
HDA3Q06623 PAM17YKR065C 594 nt11.3□□□□□ -0.6
HDA3Q06623 CWP1YKL096W 720 nt11.29□□□□□ -0.6
HDA3Q06623 ADH2YMR303C 1047 nt11.29□□□□□ -0.6
HDA3Q06623 YKR040CYKR040C 504 nt11.26□□□□□ -0.61
HDA3Q06623 SIM1YIL123W 1431 nt11.25□□□□□ -0.61
HDA3Q06623 SOR2YDL246C 1074 nt11.23□□□□□ -0.61
HDA3Q06623 SOR1YJR159W 1074 nt11.23□□□□□ -0.61
HDA3Q06623 SNF6YHL025W 999 nt11.22□□□□□ -0.61
HDA3Q06623 YCL042WYCL042W 360 nt11.22□□□□□ -0.61
HDA3Q06623 FRD1YEL047C 1413 nt11.19□□□□□ -0.62
HDA3Q06623 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.19□□□□□ -0.62
HDA3Q06623 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.19□□□□□ -0.62
HDA3Q06623 BIO4YNR057C 714 nt11.17□□□□□ -0.62
HDA3Q06623 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt11.16□□□□□ -0.62
HDA3Q06623 YFL054CYFL054C 1941 nt11.14□□□□□ -0.63
HDA3Q06623 LYS4YDR234W 2082 nt11.08□□□□□ -0.63
HDA3Q06623 YIH1YCR059C 777 nt11.08□□□□□ -0.64
HDA3Q06623 ARA2YMR041C 1008 nt11.05□□□□□ -0.64
HDA3Q06623 RNQ1YCL028W 1218 nt11.05□□□□□ -0.64
HDA3Q06623 MRPL8YJL063C 717 nt11.04□□□□□ -0.64
HDA3Q06623 YLL053CYLL053C 459 nt11.04□□□□□ -0.64
HDA3Q06623 SPP1YPL138C 1062 nt11.04□□□□□ -0.64
HDA3Q06623 SPT8YLR055C 1809 nt11.02□□□□□ -0.64
HDA3Q06623 ERF2YLR246W 1080 nt11□□□□□ -0.65
HDA3Q06623 DIC1YLR348C 897 nt10.99□□□□□ -0.65
HDA3Q06623 CRR1YLR213C 1269 nt10.98□□□□□ -0.65
HDA3Q06623 YLR122CYLR122C 378 nt10.97□□□□□ -0.65
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