Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RELQ04864 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RELQ04864 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RELQ04864 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RELQ04864 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RELQ04864 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RELQ04864 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RELQ04864 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RELQ04864 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RELQ04864 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RELQ04864 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RELQ04864 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RELQ04864 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RELQ04864 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RELQ04864 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RELQ04864 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RELQ04864 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RELQ04864 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RELQ04864 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RELQ04864 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RELQ04864 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RELQ04864 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RELQ04864 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RELQ04864 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RELQ04864 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RELQ04864 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RELQ04864 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RELQ04864 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RELQ04864 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RELQ04864 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RELQ04864 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RELQ04864 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RELQ04864 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RELQ04864 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RELQ04864 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RELQ04864 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RELQ04864 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RELQ04864 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RELQ04864 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RELQ04864 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RELQ04864 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RELQ04864 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RELQ04864 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELQ04864 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RELQ04864 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RELQ04864 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RELQ04864 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RELQ04864 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RELQ04864 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RELQ04864 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RELQ04864 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RELQ04864 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RELQ04864 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RELQ04864 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RELQ04864 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RELQ04864 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RELQ04864 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RELQ04864 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RELQ04864 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RELQ04864 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RELQ04864 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RELQ04864 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RELQ04864 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RELQ04864 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RELQ04864 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RELQ04864 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RELQ04864 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RELQ04864 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RELQ04864 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RELQ04864 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RELQ04864 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RELQ04864 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RELQ04864 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RELQ04864 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RELQ04864 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RELQ04864 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RELQ04864 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RELQ04864 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RELQ04864 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RELQ04864 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RELQ04864 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RELQ04864 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RELQ04864 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RELQ04864 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RELQ04864 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RELQ04864 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RELQ04864 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RELQ04864 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RELQ04864 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RELQ04864 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RELQ04864 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RELQ04864 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RELQ04864 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RELQ04864 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RELQ04864 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RELQ04864 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RELQ04864 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RELQ04864 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RELQ04864 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RELQ04864 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms