Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CYP27A1Q02318 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CYP27A1Q02318 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CYP27A1Q02318 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CYP27A1Q02318 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CYP27A1Q02318 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CYP27A1Q02318 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CYP27A1Q02318 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CYP27A1Q02318 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CYP27A1Q02318 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CYP27A1Q02318 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CYP27A1Q02318 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CYP27A1Q02318 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CYP27A1Q02318 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CYP27A1Q02318 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CYP27A1Q02318 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CYP27A1Q02318 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CYP27A1Q02318 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CYP27A1Q02318 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CYP27A1Q02318 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CYP27A1Q02318 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CYP27A1Q02318 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CYP27A1Q02318 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CYP27A1Q02318 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CYP27A1Q02318 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CYP27A1Q02318 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CYP27A1Q02318 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CYP27A1Q02318 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CYP27A1Q02318 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CYP27A1Q02318 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CYP27A1Q02318 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CYP27A1Q02318 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CYP27A1Q02318 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CYP27A1Q02318 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CYP27A1Q02318 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CYP27A1Q02318 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CYP27A1Q02318 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CYP27A1Q02318 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CYP27A1Q02318 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CYP27A1Q02318 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CYP27A1Q02318 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CYP27A1Q02318 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CYP27A1Q02318 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CYP27A1Q02318 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CYP27A1Q02318 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CYP27A1Q02318 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CYP27A1Q02318 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CYP27A1Q02318 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CYP27A1Q02318 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CYP27A1Q02318 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CYP27A1Q02318 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CYP27A1Q02318 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CYP27A1Q02318 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CYP27A1Q02318 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CYP27A1Q02318 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CYP27A1Q02318 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CYP27A1Q02318 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CYP27A1Q02318 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CYP27A1Q02318 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CYP27A1Q02318 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CYP27A1Q02318 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CYP27A1Q02318 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CYP27A1Q02318 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CYP27A1Q02318 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CYP27A1Q02318 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CYP27A1Q02318 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CYP27A1Q02318 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CYP27A1Q02318 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CYP27A1Q02318 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CYP27A1Q02318 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CYP27A1Q02318 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CYP27A1Q02318 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CYP27A1Q02318 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CYP27A1Q02318 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CYP27A1Q02318 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CYP27A1Q02318 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CYP27A1Q02318 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CYP27A1Q02318 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CYP27A1Q02318 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CYP27A1Q02318 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CYP27A1Q02318 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CYP27A1Q02318 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CYP27A1Q02318 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CYP27A1Q02318 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CYP27A1Q02318 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CYP27A1Q02318 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CYP27A1Q02318 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CYP27A1Q02318 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CYP27A1Q02318 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CYP27A1Q02318 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CYP27A1Q02318 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CYP27A1Q02318 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CYP27A1Q02318 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CYP27A1Q02318 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CYP27A1Q02318 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CYP27A1Q02318 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CYP27A1Q02318 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CYP27A1Q02318 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CYP27A1Q02318 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CYP27A1Q02318 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms