Protein–RNA interactions for Protein: Q01973

ROR1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROR1Q01973 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ROR1Q01973 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ROR1Q01973 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ROR1Q01973 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ROR1Q01973 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ROR1Q01973 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ROR1Q01973 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ROR1Q01973 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ROR1Q01973 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ROR1Q01973 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ROR1Q01973 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ROR1Q01973 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ROR1Q01973 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ROR1Q01973 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ROR1Q01973 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ROR1Q01973 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ROR1Q01973 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ROR1Q01973 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ROR1Q01973 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ROR1Q01973 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ROR1Q01973 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ROR1Q01973 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ROR1Q01973 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ROR1Q01973 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ROR1Q01973 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ROR1Q01973 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ROR1Q01973 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ROR1Q01973 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ROR1Q01973 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ROR1Q01973 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ROR1Q01973 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ROR1Q01973 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ROR1Q01973 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ROR1Q01973 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ROR1Q01973 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ROR1Q01973 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ROR1Q01973 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ROR1Q01973 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ROR1Q01973 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ROR1Q01973 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ROR1Q01973 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ROR1Q01973 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ROR1Q01973 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ROR1Q01973 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ROR1Q01973 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ROR1Q01973 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ROR1Q01973 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ROR1Q01973 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ROR1Q01973 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ROR1Q01973 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ROR1Q01973 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
ROR1Q01973 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ROR1Q01973 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
ROR1Q01973 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ROR1Q01973 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ROR1Q01973 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ROR1Q01973 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ROR1Q01973 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ROR1Q01973 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ROR1Q01973 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ROR1Q01973 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ROR1Q01973 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ROR1Q01973 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ROR1Q01973 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ROR1Q01973 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ROR1Q01973 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ROR1Q01973 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ROR1Q01973 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ROR1Q01973 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ROR1Q01973 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ROR1Q01973 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ROR1Q01973 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ROR1Q01973 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ROR1Q01973 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ROR1Q01973 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
ROR1Q01973 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ROR1Q01973 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
ROR1Q01973 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ROR1Q01973 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ROR1Q01973 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ROR1Q01973 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ROR1Q01973 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ROR1Q01973 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ROR1Q01973 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ROR1Q01973 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ROR1Q01973 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ROR1Q01973 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ROR1Q01973 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ROR1Q01973 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ROR1Q01973 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ROR1Q01973 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ROR1Q01973 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ROR1Q01973 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ROR1Q01973 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ROR1Q01973 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ROR1Q01973 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ROR1Q01973 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ROR1Q01973 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ROR1Q01973 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ROR1Q01973 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms