Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CDK17Q00537 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CDK17Q00537 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK17Q00537 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK17Q00537 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK17Q00537 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK17Q00537 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDK17Q00537 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CDK17Q00537 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CDK17Q00537 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CDK17Q00537 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CDK17Q00537 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CDK17Q00537 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CDK17Q00537 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
CDK17Q00537 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CDK17Q00537 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CDK17Q00537 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK17Q00537 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDK17Q00537 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK17Q00537 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDK17Q00537 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDK17Q00537 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDK17Q00537 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDK17Q00537 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK17Q00537 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CDK17Q00537 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDK17Q00537 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK17Q00537 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK17Q00537 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK17Q00537 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK17Q00537 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK17Q00537 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK17Q00537 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CDK17Q00537 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CDK17Q00537 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDK17Q00537 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK17Q00537 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CDK17Q00537 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CDK17Q00537 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK17Q00537 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK17Q00537 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK17Q00537 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK17Q00537 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CDK17Q00537 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CDK17Q00537 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDK17Q00537 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDK17Q00537 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
CDK17Q00537 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CDK17Q00537 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CDK17Q00537 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CDK17Q00537 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CDK17Q00537 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDK17Q00537 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CDK17Q00537 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK17Q00537 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDK17Q00537 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDK17Q00537 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDK17Q00537 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK17Q00537 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK17Q00537 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDK17Q00537 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDK17Q00537 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK17Q00537 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK17Q00537 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK17Q00537 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDK17Q00537 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDK17Q00537 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDK17Q00537 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK17Q00537 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK17Q00537 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK17Q00537 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK17Q00537 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK17Q00537 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK17Q00537 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CDK17Q00537 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CDK17Q00537 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CDK17Q00537 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CDK17Q00537 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CDK17Q00537 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK17Q00537 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CDK17Q00537 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CDK17Q00537 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CDK17Q00537 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CDK17Q00537 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CDK17Q00537 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CDK17Q00537 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK17Q00537 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK17Q00537 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDK17Q00537 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK17Q00537 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK17Q00537 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK17Q00537 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDK17Q00537 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CDK17Q00537 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK17Q00537 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDK17Q00537 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDK17Q00537 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK17Q00537 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDK17Q00537 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDK17Q00537 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms