Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HPCAP84074 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HPCAP84074 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HPCAP84074 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HPCAP84074 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPCAP84074 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HPCAP84074 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPCAP84074 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPCAP84074 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPCAP84074 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HPCAP84074 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HPCAP84074 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HPCAP84074 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HPCAP84074 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HPCAP84074 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HPCAP84074 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HPCAP84074 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HPCAP84074 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HPCAP84074 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HPCAP84074 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HPCAP84074 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HPCAP84074 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPCAP84074 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HPCAP84074 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HPCAP84074 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HPCAP84074 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HPCAP84074 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HPCAP84074 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HPCAP84074 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HPCAP84074 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HPCAP84074 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPCAP84074 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HPCAP84074 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPCAP84074 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPCAP84074 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HPCAP84074 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HPCAP84074 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HPCAP84074 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HPCAP84074 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HPCAP84074 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HPCAP84074 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HPCAP84074 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HPCAP84074 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HPCAP84074 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HPCAP84074 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HPCAP84074 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HPCAP84074 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HPCAP84074 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HPCAP84074 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HPCAP84074 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HPCAP84074 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HPCAP84074 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HPCAP84074 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HPCAP84074 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HPCAP84074 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HPCAP84074 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HPCAP84074 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HPCAP84074 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HPCAP84074 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HPCAP84074 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPCAP84074 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPCAP84074 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HPCAP84074 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HPCAP84074 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HPCAP84074 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HPCAP84074 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HPCAP84074 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HPCAP84074 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPCAP84074 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPCAP84074 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPCAP84074 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HPCAP84074 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HPCAP84074 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HPCAP84074 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HPCAP84074 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HPCAP84074 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HPCAP84074 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HPCAP84074 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HPCAP84074 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HPCAP84074 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPCAP84074 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPCAP84074 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPCAP84074 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPCAP84074 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPCAP84074 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPCAP84074 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPCAP84074 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPCAP84074 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPCAP84074 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPCAP84074 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HPCAP84074 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HPCAP84074 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPCAP84074 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPCAP84074 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPCAP84074 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HPCAP84074 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HPCAP84074 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPCAP84074 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPCAP84074 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPCAP84074 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms