Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNB1P62873 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNB1P62873 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNB1P62873 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNB1P62873 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNB1P62873 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GNB1P62873 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GNB1P62873 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNB1P62873 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNB1P62873 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GNB1P62873 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNB1P62873 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNB1P62873 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GNB1P62873 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNB1P62873 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GNB1P62873 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GNB1P62873 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GNB1P62873 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GNB1P62873 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GNB1P62873 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNB1P62873 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNB1P62873 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNB1P62873 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GNB1P62873 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNB1P62873 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNB1P62873 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNB1P62873 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNB1P62873 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNB1P62873 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNB1P62873 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNB1P62873 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNB1P62873 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNB1P62873 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GNB1P62873 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNB1P62873 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNB1P62873 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNB1P62873 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNB1P62873 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNB1P62873 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNB1P62873 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNB1P62873 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNB1P62873 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNB1P62873 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNB1P62873 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNB1P62873 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNB1P62873 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNB1P62873 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNB1P62873 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNB1P62873 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNB1P62873 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNB1P62873 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNB1P62873 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNB1P62873 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNB1P62873 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNB1P62873 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNB1P62873 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNB1P62873 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNB1P62873 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNB1P62873 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNB1P62873 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNB1P62873 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNB1P62873 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNB1P62873 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GNB1P62873 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNB1P62873 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNB1P62873 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNB1P62873 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNB1P62873 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNB1P62873 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNB1P62873 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GNB1P62873 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNB1P62873 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNB1P62873 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNB1P62873 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GNB1P62873 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNB1P62873 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNB1P62873 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNB1P62873 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNB1P62873 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNB1P62873 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNB1P62873 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNB1P62873 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNB1P62873 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNB1P62873 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNB1P62873 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNB1P62873 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GNB1P62873 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNB1P62873 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GNB1P62873 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNB1P62873 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNB1P62873 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNB1P62873 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNB1P62873 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNB1P62873 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNB1P62873 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNB1P62873 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNB1P62873 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNB1P62873 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNB1P62873 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNB1P62873 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms