Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL23P62829 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL23P62829 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL23P62829 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL23P62829 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL23P62829 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL23P62829 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL23P62829 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL23P62829 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL23P62829 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL23P62829 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL23P62829 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL23P62829 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL23P62829 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL23P62829 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL23P62829 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL23P62829 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL23P62829 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL23P62829 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL23P62829 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL23P62829 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL23P62829 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL23P62829 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL23P62829 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL23P62829 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL23P62829 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL23P62829 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL23P62829 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL23P62829 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL23P62829 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL23P62829 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL23P62829 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL23P62829 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL23P62829 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL23P62829 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL23P62829 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL23P62829 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL23P62829 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL23P62829 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPL23P62829 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL23P62829 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL23P62829 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL23P62829 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL23P62829 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL23P62829 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL23P62829 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL23P62829 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL23P62829 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL23P62829 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL23P62829 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL23P62829 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL23P62829 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL23P62829 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL23P62829 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL23P62829 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL23P62829 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL23P62829 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL23P62829 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL23P62829 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL23P62829 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL23P62829 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL23P62829 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL23P62829 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL23P62829 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL23P62829 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL23P62829 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL23P62829 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL23P62829 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL23P62829 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL23P62829 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL23P62829 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL23P62829 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL23P62829 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL23P62829 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL23P62829 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL23P62829 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL23P62829 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL23P62829 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL23P62829 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL23P62829 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL23P62829 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL23P62829 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL23P62829 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL23P62829 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL23P62829 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL23P62829 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL23P62829 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL23P62829 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL23P62829 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL23P62829 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL23P62829 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL23P62829 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL23P62829 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL23P62829 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL23P62829 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL23P62829 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL23P62829 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPL23P62829 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL23P62829 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL23P62829 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms