Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB1AP62820 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB1AP62820 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB1AP62820 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB1AP62820 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB1AP62820 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB1AP62820 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB1AP62820 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB1AP62820 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB1AP62820 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB1AP62820 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB1AP62820 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB1AP62820 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB1AP62820 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB1AP62820 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB1AP62820 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB1AP62820 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB1AP62820 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB1AP62820 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB1AP62820 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB1AP62820 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB1AP62820 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RAB1AP62820 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB1AP62820 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB1AP62820 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB1AP62820 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB1AP62820 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB1AP62820 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB1AP62820 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB1AP62820 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB1AP62820 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB1AP62820 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB1AP62820 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB1AP62820 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB1AP62820 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB1AP62820 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB1AP62820 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB1AP62820 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB1AP62820 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB1AP62820 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB1AP62820 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB1AP62820 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB1AP62820 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB1AP62820 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB1AP62820 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB1AP62820 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB1AP62820 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB1AP62820 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB1AP62820 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB1AP62820 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB1AP62820 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB1AP62820 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB1AP62820 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB1AP62820 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB1AP62820 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB1AP62820 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB1AP62820 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB1AP62820 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB1AP62820 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB1AP62820 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB1AP62820 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB1AP62820 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB1AP62820 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB1AP62820 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB1AP62820 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB1AP62820 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB1AP62820 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB1AP62820 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB1AP62820 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB1AP62820 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB1AP62820 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB1AP62820 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB1AP62820 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB1AP62820 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB1AP62820 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB1AP62820 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB1AP62820 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB1AP62820 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB1AP62820 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB1AP62820 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB1AP62820 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB1AP62820 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB1AP62820 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB1AP62820 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB1AP62820 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB1AP62820 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB1AP62820 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB1AP62820 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB1AP62820 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB1AP62820 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB1AP62820 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB1AP62820 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB1AP62820 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB1AP62820 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB1AP62820 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB1AP62820 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB1AP62820 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB1AP62820 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB1AP62820 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB1AP62820 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms