Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL23AP62750 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL23AP62750 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL23AP62750 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL23AP62750 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL23AP62750 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL23AP62750 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL23AP62750 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL23AP62750 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL23AP62750 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL23AP62750 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL23AP62750 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL23AP62750 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL23AP62750 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL23AP62750 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL23AP62750 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL23AP62750 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL23AP62750 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL23AP62750 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL23AP62750 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL23AP62750 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL23AP62750 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL23AP62750 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL23AP62750 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL23AP62750 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL23AP62750 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL23AP62750 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL23AP62750 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL23AP62750 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL23AP62750 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL23AP62750 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL23AP62750 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL23AP62750 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL23AP62750 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPL23AP62750 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPL23AP62750 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL23AP62750 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL23AP62750 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL23AP62750 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL23AP62750 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL23AP62750 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL23AP62750 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL23AP62750 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL23AP62750 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL23AP62750 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL23AP62750 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL23AP62750 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL23AP62750 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL23AP62750 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL23AP62750 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL23AP62750 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL23AP62750 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL23AP62750 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL23AP62750 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL23AP62750 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL23AP62750 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL23AP62750 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL23AP62750 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL23AP62750 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL23AP62750 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL23AP62750 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL23AP62750 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL23AP62750 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL23AP62750 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL23AP62750 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL23AP62750 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL23AP62750 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL23AP62750 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL23AP62750 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL23AP62750 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL23AP62750 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL23AP62750 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL23AP62750 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL23AP62750 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL23AP62750 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL23AP62750 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL23AP62750 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL23AP62750 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL23AP62750 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL23AP62750 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL23AP62750 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL23AP62750 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL23AP62750 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL23AP62750 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL23AP62750 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL23AP62750 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL23AP62750 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL23AP62750 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL23AP62750 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL23AP62750 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL23AP62750 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL23AP62750 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL23AP62750 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL23AP62750 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL23AP62750 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL23AP62750 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL23AP62750 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL23AP62750 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL23AP62750 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL23AP62750 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms