Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS4XP62701 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS4XP62701 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS4XP62701 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS4XP62701 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RPS4XP62701 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS4XP62701 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS4XP62701 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS4XP62701 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS4XP62701 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPS4XP62701 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPS4XP62701 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPS4XP62701 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPS4XP62701 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS4XP62701 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS4XP62701 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPS4XP62701 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS4XP62701 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPS4XP62701 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS4XP62701 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS4XP62701 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS4XP62701 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS4XP62701 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPS4XP62701 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPS4XP62701 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPS4XP62701 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPS4XP62701 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPS4XP62701 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPS4XP62701 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS4XP62701 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RPS4XP62701 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPS4XP62701 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPS4XP62701 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPS4XP62701 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPS4XP62701 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPS4XP62701 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPS4XP62701 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPS4XP62701 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS4XP62701 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS4XP62701 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS4XP62701 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS4XP62701 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS4XP62701 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS4XP62701 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS4XP62701 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS4XP62701 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS4XP62701 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS4XP62701 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS4XP62701 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS4XP62701 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS4XP62701 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS4XP62701 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS4XP62701 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS4XP62701 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS4XP62701 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS4XP62701 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS4XP62701 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS4XP62701 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS4XP62701 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS4XP62701 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS4XP62701 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS4XP62701 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS4XP62701 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS4XP62701 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS4XP62701 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS4XP62701 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS4XP62701 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS4XP62701 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS4XP62701 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS4XP62701 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS4XP62701 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS4XP62701 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS4XP62701 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS4XP62701 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS4XP62701 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS4XP62701 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS4XP62701 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS4XP62701 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS4XP62701 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS4XP62701 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS4XP62701 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS4XP62701 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS4XP62701 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS4XP62701 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS4XP62701 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS4XP62701 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS4XP62701 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS4XP62701 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS4XP62701 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS4XP62701 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS4XP62701 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS4XP62701 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPS4XP62701 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS4XP62701 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS4XP62701 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS4XP62701 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS4XP62701 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS4XP62701 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS4XP62701 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS4XP62701 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms