Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPEP62304 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPEP62304 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPEP62304 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPEP62304 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRPEP62304 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPEP62304 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPEP62304 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPEP62304 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPEP62304 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPEP62304 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPEP62304 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPEP62304 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPEP62304 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPEP62304 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPEP62304 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPEP62304 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPEP62304 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPEP62304 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPEP62304 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPEP62304 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPEP62304 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPEP62304 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPEP62304 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPEP62304 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPEP62304 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPEP62304 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPEP62304 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPEP62304 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPEP62304 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPEP62304 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPEP62304 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPEP62304 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPEP62304 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPEP62304 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPEP62304 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPEP62304 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPEP62304 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPEP62304 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPEP62304 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPEP62304 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPEP62304 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPEP62304 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPEP62304 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPEP62304 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPEP62304 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPEP62304 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPEP62304 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPEP62304 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPEP62304 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPEP62304 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPEP62304 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPEP62304 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPEP62304 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPEP62304 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPEP62304 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPEP62304 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPEP62304 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPEP62304 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPEP62304 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPEP62304 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPEP62304 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPEP62304 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPEP62304 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPEP62304 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPEP62304 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPEP62304 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPEP62304 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPEP62304 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPEP62304 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNRPEP62304 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPEP62304 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPEP62304 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPEP62304 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPEP62304 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPEP62304 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPEP62304 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPEP62304 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPEP62304 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPEP62304 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPEP62304 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPEP62304 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPEP62304 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPEP62304 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPEP62304 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPEP62304 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPEP62304 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPEP62304 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPEP62304 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPEP62304 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPEP62304 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPEP62304 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPEP62304 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNRPEP62304 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPEP62304 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPEP62304 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPEP62304 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPEP62304 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPEP62304 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPEP62304 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms