Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCALDP61601 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCALDP61601 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCALDP61601 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCALDP61601 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCALDP61601 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCALDP61601 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCALDP61601 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCALDP61601 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCALDP61601 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCALDP61601 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCALDP61601 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCALDP61601 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCALDP61601 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCALDP61601 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCALDP61601 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCALDP61601 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCALDP61601 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCALDP61601 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCALDP61601 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCALDP61601 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCALDP61601 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCALDP61601 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCALDP61601 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCALDP61601 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCALDP61601 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCALDP61601 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCALDP61601 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCALDP61601 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCALDP61601 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCALDP61601 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCALDP61601 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCALDP61601 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCALDP61601 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCALDP61601 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCALDP61601 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCALDP61601 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCALDP61601 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCALDP61601 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCALDP61601 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCALDP61601 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCALDP61601 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCALDP61601 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCALDP61601 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCALDP61601 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCALDP61601 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCALDP61601 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCALDP61601 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCALDP61601 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCALDP61601 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCALDP61601 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCALDP61601 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCALDP61601 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCALDP61601 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCALDP61601 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCALDP61601 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCALDP61601 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NCALDP61601 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NCALDP61601 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCALDP61601 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCALDP61601 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCALDP61601 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NCALDP61601 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCALDP61601 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCALDP61601 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCALDP61601 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCALDP61601 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCALDP61601 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCALDP61601 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCALDP61601 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCALDP61601 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCALDP61601 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCALDP61601 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NCALDP61601 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCALDP61601 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCALDP61601 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCALDP61601 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NCALDP61601 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCALDP61601 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCALDP61601 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCALDP61601 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NCALDP61601 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NCALDP61601 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NCALDP61601 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCALDP61601 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCALDP61601 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCALDP61601 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCALDP61601 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NCALDP61601 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCALDP61601 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCALDP61601 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCALDP61601 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCALDP61601 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCALDP61601 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCALDP61601 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NCALDP61601 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NCALDP61601 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NCALDP61601 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NCALDP61601 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
NCALDP61601 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms