Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SPCS3P61009 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPCS3P61009 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPCS3P61009 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPCS3P61009 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPCS3P61009 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPCS3P61009 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPCS3P61009 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPCS3P61009 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPCS3P61009 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPCS3P61009 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPCS3P61009 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPCS3P61009 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPCS3P61009 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPCS3P61009 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPCS3P61009 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPCS3P61009 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPCS3P61009 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPCS3P61009 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPCS3P61009 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPCS3P61009 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPCS3P61009 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPCS3P61009 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPCS3P61009 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPCS3P61009 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPCS3P61009 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPCS3P61009 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPCS3P61009 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPCS3P61009 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPCS3P61009 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPCS3P61009 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPCS3P61009 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPCS3P61009 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPCS3P61009 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPCS3P61009 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPCS3P61009 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPCS3P61009 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPCS3P61009 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPCS3P61009 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPCS3P61009 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPCS3P61009 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPCS3P61009 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPCS3P61009 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPCS3P61009 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPCS3P61009 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPCS3P61009 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPCS3P61009 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPCS3P61009 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPCS3P61009 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPCS3P61009 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPCS3P61009 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPCS3P61009 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPCS3P61009 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPCS3P61009 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPCS3P61009 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPCS3P61009 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPCS3P61009 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPCS3P61009 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPCS3P61009 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPCS3P61009 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPCS3P61009 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPCS3P61009 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPCS3P61009 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPCS3P61009 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPCS3P61009 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPCS3P61009 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPCS3P61009 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPCS3P61009 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPCS3P61009 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPCS3P61009 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPCS3P61009 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPCS3P61009 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPCS3P61009 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPCS3P61009 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPCS3P61009 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPCS3P61009 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPCS3P61009 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPCS3P61009 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPCS3P61009 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPCS3P61009 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPCS3P61009 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPCS3P61009 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPCS3P61009 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPCS3P61009 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPCS3P61009 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPCS3P61009 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPCS3P61009 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPCS3P61009 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPCS3P61009 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPCS3P61009 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPCS3P61009 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPCS3P61009 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPCS3P61009 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPCS3P61009 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPCS3P61009 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPCS3P61009 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPCS3P61009 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPCS3P61009 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPCS3P61009 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPCS3P61009 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms