Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTXN1P60606 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTXN1P60606 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTXN1P60606 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTXN1P60606 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTXN1P60606 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTXN1P60606 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTXN1P60606 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTXN1P60606 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTXN1P60606 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTXN1P60606 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTXN1P60606 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTXN1P60606 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTXN1P60606 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTXN1P60606 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTXN1P60606 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTXN1P60606 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTXN1P60606 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTXN1P60606 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTXN1P60606 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTXN1P60606 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTXN1P60606 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTXN1P60606 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTXN1P60606 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTXN1P60606 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTXN1P60606 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTXN1P60606 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTXN1P60606 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CTXN1P60606 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTXN1P60606 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTXN1P60606 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTXN1P60606 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTXN1P60606 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTXN1P60606 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTXN1P60606 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTXN1P60606 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTXN1P60606 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTXN1P60606 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTXN1P60606 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTXN1P60606 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTXN1P60606 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTXN1P60606 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTXN1P60606 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTXN1P60606 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTXN1P60606 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTXN1P60606 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTXN1P60606 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTXN1P60606 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTXN1P60606 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTXN1P60606 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTXN1P60606 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTXN1P60606 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTXN1P60606 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CTXN1P60606 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTXN1P60606 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTXN1P60606 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTXN1P60606 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTXN1P60606 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTXN1P60606 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTXN1P60606 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTXN1P60606 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTXN1P60606 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTXN1P60606 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTXN1P60606 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTXN1P60606 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTXN1P60606 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTXN1P60606 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTXN1P60606 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTXN1P60606 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTXN1P60606 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTXN1P60606 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTXN1P60606 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTXN1P60606 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTXN1P60606 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTXN1P60606 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTXN1P60606 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTXN1P60606 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTXN1P60606 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTXN1P60606 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTXN1P60606 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTXN1P60606 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTXN1P60606 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTXN1P60606 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTXN1P60606 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTXN1P60606 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTXN1P60606 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTXN1P60606 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTXN1P60606 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTXN1P60606 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTXN1P60606 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTXN1P60606 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTXN1P60606 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTXN1P60606 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTXN1P60606 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTXN1P60606 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTXN1P60606 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTXN1P60606 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTXN1P60606 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTXN1P60606 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTXN1P60606 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms