Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB15P59190 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB15P59190 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB15P59190 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB15P59190 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB15P59190 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB15P59190 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB15P59190 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB15P59190 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB15P59190 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB15P59190 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB15P59190 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB15P59190 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB15P59190 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB15P59190 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB15P59190 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB15P59190 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB15P59190 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB15P59190 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB15P59190 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB15P59190 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB15P59190 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB15P59190 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB15P59190 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB15P59190 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB15P59190 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB15P59190 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB15P59190 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB15P59190 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB15P59190 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB15P59190 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB15P59190 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB15P59190 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB15P59190 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB15P59190 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB15P59190 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB15P59190 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB15P59190 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RAB15P59190 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAB15P59190 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAB15P59190 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB15P59190 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB15P59190 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB15P59190 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB15P59190 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB15P59190 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB15P59190 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB15P59190 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB15P59190 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB15P59190 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAB15P59190 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB15P59190 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB15P59190 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB15P59190 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB15P59190 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB15P59190 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB15P59190 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB15P59190 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB15P59190 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB15P59190 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB15P59190 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB15P59190 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB15P59190 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB15P59190 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB15P59190 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB15P59190 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB15P59190 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB15P59190 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB15P59190 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB15P59190 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB15P59190 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RAB15P59190 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB15P59190 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB15P59190 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB15P59190 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB15P59190 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB15P59190 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB15P59190 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB15P59190 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB15P59190 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB15P59190 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB15P59190 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB15P59190 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB15P59190 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB15P59190 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB15P59190 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB15P59190 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB15P59190 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB15P59190 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB15P59190 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB15P59190 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB15P59190 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB15P59190 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB15P59190 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB15P59190 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB15P59190 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB15P59190 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB15P59190 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB15P59190 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB15P59190 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms