Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
STX17P56962 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
STX17P56962 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
STX17P56962 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
STX17P56962 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
STX17P56962 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
STX17P56962 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
STX17P56962 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
STX17P56962 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
STX17P56962 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
STX17P56962 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
STX17P56962 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
STX17P56962 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
STX17P56962 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
STX17P56962 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
STX17P56962 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
STX17P56962 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
STX17P56962 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
STX17P56962 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
STX17P56962 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
STX17P56962 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
STX17P56962 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
STX17P56962 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
STX17P56962 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
STX17P56962 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
STX17P56962 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
STX17P56962 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
STX17P56962 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
STX17P56962 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
STX17P56962 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
STX17P56962 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
STX17P56962 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
STX17P56962 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
STX17P56962 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
STX17P56962 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
STX17P56962 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
STX17P56962 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
STX17P56962 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
STX17P56962 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
STX17P56962 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
STX17P56962 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
STX17P56962 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
STX17P56962 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
STX17P56962 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
STX17P56962 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
STX17P56962 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
STX17P56962 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
STX17P56962 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
STX17P56962 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
STX17P56962 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
STX17P56962 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
STX17P56962 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
STX17P56962 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
STX17P56962 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
STX17P56962 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
STX17P56962 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
STX17P56962 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
STX17P56962 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
STX17P56962 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
STX17P56962 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
STX17P56962 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
STX17P56962 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
STX17P56962 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
STX17P56962 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
STX17P56962 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
STX17P56962 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
STX17P56962 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
STX17P56962 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
STX17P56962 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
STX17P56962 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
STX17P56962 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
STX17P56962 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
STX17P56962 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
STX17P56962 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
STX17P56962 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
STX17P56962 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
STX17P56962 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
STX17P56962 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
STX17P56962 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
STX17P56962 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
STX17P56962 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
STX17P56962 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
STX17P56962 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
STX17P56962 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
STX17P56962 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
STX17P56962 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
STX17P56962 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
STX17P56962 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
STX17P56962 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
STX17P56962 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
STX17P56962 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
STX17P56962 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
STX17P56962 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
STX17P56962 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
STX17P56962 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
STX17P56962 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
STX17P56962 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
STX17P56962 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
STX17P56962 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
STX17P56962 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms