Protein–RNA interactions for Protein: P56279

TCL1A, T-cell leukemia/lymphoma protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCL1AP56279 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCL1AP56279 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCL1AP56279 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCL1AP56279 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCL1AP56279 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCL1AP56279 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCL1AP56279 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCL1AP56279 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCL1AP56279 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCL1AP56279 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCL1AP56279 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCL1AP56279 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCL1AP56279 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCL1AP56279 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCL1AP56279 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCL1AP56279 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCL1AP56279 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCL1AP56279 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCL1AP56279 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCL1AP56279 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCL1AP56279 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCL1AP56279 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCL1AP56279 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCL1AP56279 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCL1AP56279 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCL1AP56279 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCL1AP56279 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCL1AP56279 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCL1AP56279 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCL1AP56279 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCL1AP56279 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCL1AP56279 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCL1AP56279 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCL1AP56279 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCL1AP56279 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCL1AP56279 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCL1AP56279 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCL1AP56279 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCL1AP56279 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCL1AP56279 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TCL1AP56279 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCL1AP56279 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCL1AP56279 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCL1AP56279 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCL1AP56279 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCL1AP56279 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCL1AP56279 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCL1AP56279 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCL1AP56279 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCL1AP56279 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCL1AP56279 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCL1AP56279 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCL1AP56279 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCL1AP56279 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCL1AP56279 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCL1AP56279 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCL1AP56279 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCL1AP56279 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCL1AP56279 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCL1AP56279 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCL1AP56279 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCL1AP56279 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCL1AP56279 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TCL1AP56279 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCL1AP56279 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCL1AP56279 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCL1AP56279 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCL1AP56279 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCL1AP56279 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCL1AP56279 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCL1AP56279 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCL1AP56279 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCL1AP56279 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCL1AP56279 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCL1AP56279 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCL1AP56279 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCL1AP56279 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCL1AP56279 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCL1AP56279 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCL1AP56279 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCL1AP56279 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCL1AP56279 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCL1AP56279 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCL1AP56279 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCL1AP56279 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCL1AP56279 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCL1AP56279 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCL1AP56279 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCL1AP56279 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCL1AP56279 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCL1AP56279 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TCL1AP56279 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCL1AP56279 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCL1AP56279 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCL1AP56279 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCL1AP56279 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCL1AP56279 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCL1AP56279 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCL1AP56279 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCL1AP56279 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms