Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPTEP56180 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPTEP56180 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPTEP56180 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPTEP56180 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPTEP56180 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPTEP56180 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPTEP56180 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPTEP56180 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPTEP56180 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TPTEP56180 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPTEP56180 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPTEP56180 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPTEP56180 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPTEP56180 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TPTEP56180 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPTEP56180 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPTEP56180 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPTEP56180 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TPTEP56180 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPTEP56180 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPTEP56180 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPTEP56180 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPTEP56180 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPTEP56180 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPTEP56180 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPTEP56180 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPTEP56180 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPTEP56180 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPTEP56180 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPTEP56180 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPTEP56180 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPTEP56180 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPTEP56180 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPTEP56180 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPTEP56180 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPTEP56180 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPTEP56180 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPTEP56180 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPTEP56180 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPTEP56180 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPTEP56180 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPTEP56180 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPTEP56180 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPTEP56180 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TPTEP56180 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPTEP56180 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TPTEP56180 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPTEP56180 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPTEP56180 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPTEP56180 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPTEP56180 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPTEP56180 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPTEP56180 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPTEP56180 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPTEP56180 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPTEP56180 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPTEP56180 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPTEP56180 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPTEP56180 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPTEP56180 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPTEP56180 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPTEP56180 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPTEP56180 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPTEP56180 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPTEP56180 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPTEP56180 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPTEP56180 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPTEP56180 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPTEP56180 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPTEP56180 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPTEP56180 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPTEP56180 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPTEP56180 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPTEP56180 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPTEP56180 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPTEP56180 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPTEP56180 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPTEP56180 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPTEP56180 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPTEP56180 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TPTEP56180 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPTEP56180 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPTEP56180 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPTEP56180 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPTEP56180 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPTEP56180 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPTEP56180 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPTEP56180 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPTEP56180 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPTEP56180 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPTEP56180 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPTEP56180 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPTEP56180 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPTEP56180 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPTEP56180 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPTEP56180 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPTEP56180 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPTEP56180 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPTEP56180 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms