Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH3BGRP55822 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH3BGRP55822 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3BGRP55822 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3BGRP55822 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3BGRP55822 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH3BGRP55822 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH3BGRP55822 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SH3BGRP55822 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SH3BGRP55822 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH3BGRP55822 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH3BGRP55822 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SH3BGRP55822 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SH3BGRP55822 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3BGRP55822 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH3BGRP55822 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH3BGRP55822 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3BGRP55822 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3BGRP55822 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3BGRP55822 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3BGRP55822 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SH3BGRP55822 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3BGRP55822 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3BGRP55822 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3BGRP55822 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3BGRP55822 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH3BGRP55822 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3BGRP55822 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3BGRP55822 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3BGRP55822 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3BGRP55822 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH3BGRP55822 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH3BGRP55822 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3BGRP55822 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3BGRP55822 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3BGRP55822 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3BGRP55822 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3BGRP55822 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3BGRP55822 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3BGRP55822 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3BGRP55822 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3BGRP55822 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3BGRP55822 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3BGRP55822 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3BGRP55822 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3BGRP55822 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH3BGRP55822 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH3BGRP55822 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH3BGRP55822 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH3BGRP55822 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH3BGRP55822 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH3BGRP55822 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH3BGRP55822 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH3BGRP55822 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH3BGRP55822 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH3BGRP55822 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3BGRP55822 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SH3BGRP55822 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH3BGRP55822 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3BGRP55822 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3BGRP55822 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3BGRP55822 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3BGRP55822 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3BGRP55822 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3BGRP55822 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3BGRP55822 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3BGRP55822 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH3BGRP55822 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH3BGRP55822 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH3BGRP55822 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH3BGRP55822 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3BGRP55822 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3BGRP55822 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH3BGRP55822 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH3BGRP55822 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH3BGRP55822 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH3BGRP55822 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH3BGRP55822 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH3BGRP55822 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3BGRP55822 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SH3BGRP55822 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SH3BGRP55822 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH3BGRP55822 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH3BGRP55822 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH3BGRP55822 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SH3BGRP55822 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SH3BGRP55822 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH3BGRP55822 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH3BGRP55822 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SH3BGRP55822 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SH3BGRP55822 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH3BGRP55822 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH3BGRP55822 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH3BGRP55822 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SH3BGRP55822 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH3BGRP55822 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH3BGRP55822 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH3BGRP55822 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH3BGRP55822 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH3BGRP55822 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms