Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNU13P55769 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SNU13P55769 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNU13P55769 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNU13P55769 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNU13P55769 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNU13P55769 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNU13P55769 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNU13P55769 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNU13P55769 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNU13P55769 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNU13P55769 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNU13P55769 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNU13P55769 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNU13P55769 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNU13P55769 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNU13P55769 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNU13P55769 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNU13P55769 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNU13P55769 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNU13P55769 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNU13P55769 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNU13P55769 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNU13P55769 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNU13P55769 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNU13P55769 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNU13P55769 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNU13P55769 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNU13P55769 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNU13P55769 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNU13P55769 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNU13P55769 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNU13P55769 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNU13P55769 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNU13P55769 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNU13P55769 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNU13P55769 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNU13P55769 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNU13P55769 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNU13P55769 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNU13P55769 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNU13P55769 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNU13P55769 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNU13P55769 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNU13P55769 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNU13P55769 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNU13P55769 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNU13P55769 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNU13P55769 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNU13P55769 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNU13P55769 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNU13P55769 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNU13P55769 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNU13P55769 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNU13P55769 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNU13P55769 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNU13P55769 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNU13P55769 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNU13P55769 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNU13P55769 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNU13P55769 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNU13P55769 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SNU13P55769 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNU13P55769 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNU13P55769 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNU13P55769 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNU13P55769 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNU13P55769 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNU13P55769 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNU13P55769 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNU13P55769 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNU13P55769 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNU13P55769 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNU13P55769 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNU13P55769 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNU13P55769 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNU13P55769 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNU13P55769 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNU13P55769 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNU13P55769 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNU13P55769 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNU13P55769 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNU13P55769 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNU13P55769 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNU13P55769 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNU13P55769 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNU13P55769 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNU13P55769 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNU13P55769 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNU13P55769 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNU13P55769 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNU13P55769 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNU13P55769 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNU13P55769 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNU13P55769 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNU13P55769 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNU13P55769 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNU13P55769 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNU13P55769 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNU13P55769 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms