Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CASP7P55210 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
CASP7P55210 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CASP7P55210 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CASP7P55210 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CASP7P55210 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CASP7P55210 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CASP7P55210 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CASP7P55210 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CASP7P55210 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CASP7P55210 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CASP7P55210 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CASP7P55210 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CASP7P55210 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CASP7P55210 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CASP7P55210 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CASP7P55210 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CASP7P55210 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
CASP7P55210 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CASP7P55210 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CASP7P55210 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CASP7P55210 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CASP7P55210 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CASP7P55210 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CASP7P55210 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CASP7P55210 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
CASP7P55210 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CASP7P55210 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CASP7P55210 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CASP7P55210 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
CASP7P55210 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CASP7P55210 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CASP7P55210 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CASP7P55210 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CASP7P55210 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CASP7P55210 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CASP7P55210 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CASP7P55210 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CASP7P55210 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CASP7P55210 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CASP7P55210 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CASP7P55210 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CASP7P55210 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CASP7P55210 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CASP7P55210 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CASP7P55210 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CASP7P55210 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CASP7P55210 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CASP7P55210 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CASP7P55210 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CASP7P55210 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CASP7P55210 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CASP7P55210 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CASP7P55210 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CASP7P55210 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CASP7P55210 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CASP7P55210 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CASP7P55210 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CASP7P55210 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CASP7P55210 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CASP7P55210 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CASP7P55210 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CASP7P55210 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CASP7P55210 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CASP7P55210 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CASP7P55210 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CASP7P55210 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CASP7P55210 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CASP7P55210 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CASP7P55210 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CASP7P55210 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CASP7P55210 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CASP7P55210 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CASP7P55210 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CASP7P55210 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CASP7P55210 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CASP7P55210 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CASP7P55210 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CASP7P55210 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CASP7P55210 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CASP7P55210 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CASP7P55210 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CASP7P55210 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CASP7P55210 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CASP7P55210 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
CASP7P55210 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
CASP7P55210 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CASP7P55210 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CASP7P55210 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CASP7P55210 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CASP7P55210 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CASP7P55210 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CASP7P55210 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CASP7P55210 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CASP7P55210 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CASP7P55210 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
CASP7P55210 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CASP7P55210 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CASP7P55210 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CASP7P55210 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms