Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GYS2P54840 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GYS2P54840 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GYS2P54840 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GYS2P54840 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GYS2P54840 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GYS2P54840 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GYS2P54840 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GYS2P54840 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GYS2P54840 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GYS2P54840 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GYS2P54840 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GYS2P54840 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GYS2P54840 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GYS2P54840 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GYS2P54840 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GYS2P54840 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GYS2P54840 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GYS2P54840 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GYS2P54840 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GYS2P54840 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GYS2P54840 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GYS2P54840 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GYS2P54840 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GYS2P54840 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GYS2P54840 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GYS2P54840 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GYS2P54840 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GYS2P54840 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GYS2P54840 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GYS2P54840 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GYS2P54840 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GYS2P54840 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GYS2P54840 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GYS2P54840 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GYS2P54840 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GYS2P54840 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GYS2P54840 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GYS2P54840 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GYS2P54840 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GYS2P54840 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GYS2P54840 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GYS2P54840 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GYS2P54840 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GYS2P54840 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GYS2P54840 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GYS2P54840 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GYS2P54840 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GYS2P54840 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GYS2P54840 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GYS2P54840 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GYS2P54840 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GYS2P54840 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GYS2P54840 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GYS2P54840 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GYS2P54840 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GYS2P54840 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GYS2P54840 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GYS2P54840 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GYS2P54840 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GYS2P54840 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GYS2P54840 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GYS2P54840 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GYS2P54840 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GYS2P54840 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GYS2P54840 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GYS2P54840 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GYS2P54840 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GYS2P54840 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GYS2P54840 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GYS2P54840 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GYS2P54840 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GYS2P54840 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GYS2P54840 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GYS2P54840 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GYS2P54840 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GYS2P54840 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GYS2P54840 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GYS2P54840 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GYS2P54840 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GYS2P54840 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GYS2P54840 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GYS2P54840 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GYS2P54840 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GYS2P54840 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GYS2P54840 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GYS2P54840 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GYS2P54840 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GYS2P54840 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GYS2P54840 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GYS2P54840 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GYS2P54840 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GYS2P54840 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GYS2P54840 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GYS2P54840 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GYS2P54840 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GYS2P54840 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GYS2P54840 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GYS2P54840 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GYS2P54840 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms