Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATXN1P54253 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATXN1P54253 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ATXN1P54253 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATXN1P54253 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATXN1P54253 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATXN1P54253 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ATXN1P54253 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ATXN1P54253 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATXN1P54253 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ATXN1P54253 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATXN1P54253 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATXN1P54253 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATXN1P54253 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATXN1P54253 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATXN1P54253 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATXN1P54253 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATXN1P54253 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATXN1P54253 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATXN1P54253 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATXN1P54253 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATXN1P54253 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATXN1P54253 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ATXN1P54253 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATXN1P54253 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATXN1P54253 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATXN1P54253 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATXN1P54253 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATXN1P54253 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATXN1P54253 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATXN1P54253 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATXN1P54253 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATXN1P54253 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATXN1P54253 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATXN1P54253 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATXN1P54253 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATXN1P54253 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATXN1P54253 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATXN1P54253 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATXN1P54253 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATXN1P54253 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATXN1P54253 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATXN1P54253 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATXN1P54253 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATXN1P54253 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATXN1P54253 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATXN1P54253 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATXN1P54253 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATXN1P54253 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATXN1P54253 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATXN1P54253 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATXN1P54253 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ATXN1P54253 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATXN1P54253 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATXN1P54253 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATXN1P54253 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATXN1P54253 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATXN1P54253 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATXN1P54253 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATXN1P54253 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATXN1P54253 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATXN1P54253 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATXN1P54253 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATXN1P54253 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATXN1P54253 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATXN1P54253 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATXN1P54253 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATXN1P54253 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATXN1P54253 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATXN1P54253 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATXN1P54253 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATXN1P54253 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATXN1P54253 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATXN1P54253 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATXN1P54253 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATXN1P54253 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATXN1P54253 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATXN1P54253 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ATXN1P54253 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATXN1P54253 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATXN1P54253 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATXN1P54253 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATXN1P54253 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATXN1P54253 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATXN1P54253 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATXN1P54253 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATXN1P54253 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATXN1P54253 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATXN1P54253 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATXN1P54253 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATXN1P54253 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATXN1P54253 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATXN1P54253 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATXN1P54253 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATXN1P54253 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATXN1P54253 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATXN1P54253 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATXN1P54253 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATXN1P54253 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATXN1P54253 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms