Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NUBP1P53384 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
NUBP1P53384 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NUBP1P53384 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NUBP1P53384 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NUBP1P53384 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NUBP1P53384 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
NUBP1P53384 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
NUBP1P53384 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUBP1P53384 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUBP1P53384 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUBP1P53384 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUBP1P53384 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUBP1P53384 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NUBP1P53384 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
NUBP1P53384 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUBP1P53384 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUBP1P53384 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUBP1P53384 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NUBP1P53384 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUBP1P53384 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUBP1P53384 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUBP1P53384 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUBP1P53384 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUBP1P53384 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUBP1P53384 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUBP1P53384 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUBP1P53384 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUBP1P53384 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUBP1P53384 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUBP1P53384 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUBP1P53384 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUBP1P53384 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUBP1P53384 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUBP1P53384 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NUBP1P53384 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NUBP1P53384 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUBP1P53384 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUBP1P53384 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUBP1P53384 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUBP1P53384 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUBP1P53384 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUBP1P53384 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUBP1P53384 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NUBP1P53384 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUBP1P53384 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUBP1P53384 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUBP1P53384 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUBP1P53384 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUBP1P53384 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NUBP1P53384 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUBP1P53384 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUBP1P53384 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUBP1P53384 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUBP1P53384 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUBP1P53384 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NUBP1P53384 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUBP1P53384 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUBP1P53384 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUBP1P53384 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUBP1P53384 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NUBP1P53384 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUBP1P53384 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUBP1P53384 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUBP1P53384 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUBP1P53384 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUBP1P53384 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NUBP1P53384 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUBP1P53384 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUBP1P53384 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUBP1P53384 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUBP1P53384 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUBP1P53384 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUBP1P53384 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUBP1P53384 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUBP1P53384 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUBP1P53384 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUBP1P53384 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUBP1P53384 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUBP1P53384 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUBP1P53384 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUBP1P53384 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NUBP1P53384 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NUBP1P53384 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUBP1P53384 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NUBP1P53384 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NUBP1P53384 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUBP1P53384 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUBP1P53384 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUBP1P53384 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUBP1P53384 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUBP1P53384 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUBP1P53384 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUBP1P53384 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUBP1P53384 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUBP1P53384 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUBP1P53384 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUBP1P53384 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUBP1P53384 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NUBP1P53384 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms