Protein–RNA interactions for Protein: P51946

CCNH, Cyclin-H, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNHP51946 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCNHP51946 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCNHP51946 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCNHP51946 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCNHP51946 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCNHP51946 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCNHP51946 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCNHP51946 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCNHP51946 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCNHP51946 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCNHP51946 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCNHP51946 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CCNHP51946 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCNHP51946 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCNHP51946 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCNHP51946 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCNHP51946 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCNHP51946 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCNHP51946 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCNHP51946 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCNHP51946 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCNHP51946 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CCNHP51946 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCNHP51946 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCNHP51946 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCNHP51946 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCNHP51946 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCNHP51946 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCNHP51946 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCNHP51946 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCNHP51946 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCNHP51946 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCNHP51946 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCNHP51946 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCNHP51946 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCNHP51946 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCNHP51946 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCNHP51946 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCNHP51946 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCNHP51946 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCNHP51946 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCNHP51946 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CCNHP51946 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCNHP51946 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNHP51946 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNHP51946 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCNHP51946 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCNHP51946 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCNHP51946 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCNHP51946 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCNHP51946 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCNHP51946 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCNHP51946 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCNHP51946 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNHP51946 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNHP51946 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNHP51946 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNHP51946 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCNHP51946 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNHP51946 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNHP51946 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNHP51946 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNHP51946 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNHP51946 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNHP51946 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNHP51946 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNHP51946 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNHP51946 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNHP51946 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCNHP51946 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCNHP51946 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNHP51946 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNHP51946 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNHP51946 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNHP51946 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNHP51946 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNHP51946 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCNHP51946 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCNHP51946 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCNHP51946 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNHP51946 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCNHP51946 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCNHP51946 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCNHP51946 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCNHP51946 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCNHP51946 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCNHP51946 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCNHP51946 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCNHP51946 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCNHP51946 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCNHP51946 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCNHP51946 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNHP51946 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCNHP51946 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCNHP51946 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCNHP51946 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNHP51946 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNHP51946 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNHP51946 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCNHP51946 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms