Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PEX5P50542 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PEX5P50542 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PEX5P50542 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PEX5P50542 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PEX5P50542 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PEX5P50542 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PEX5P50542 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PEX5P50542 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PEX5P50542 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PEX5P50542 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PEX5P50542 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PEX5P50542 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PEX5P50542 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PEX5P50542 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PEX5P50542 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PEX5P50542 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PEX5P50542 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PEX5P50542 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PEX5P50542 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PEX5P50542 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PEX5P50542 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PEX5P50542 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PEX5P50542 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PEX5P50542 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PEX5P50542 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PEX5P50542 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PEX5P50542 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PEX5P50542 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PEX5P50542 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PEX5P50542 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PEX5P50542 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PEX5P50542 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PEX5P50542 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PEX5P50542 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PEX5P50542 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PEX5P50542 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PEX5P50542 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PEX5P50542 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PEX5P50542 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PEX5P50542 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PEX5P50542 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PEX5P50542 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PEX5P50542 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PEX5P50542 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PEX5P50542 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PEX5P50542 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PEX5P50542 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PEX5P50542 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PEX5P50542 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PEX5P50542 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PEX5P50542 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PEX5P50542 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PEX5P50542 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PEX5P50542 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PEX5P50542 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PEX5P50542 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PEX5P50542 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PEX5P50542 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PEX5P50542 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PEX5P50542 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PEX5P50542 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PEX5P50542 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PEX5P50542 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PEX5P50542 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PEX5P50542 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PEX5P50542 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PEX5P50542 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PEX5P50542 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PEX5P50542 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PEX5P50542 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PEX5P50542 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PEX5P50542 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PEX5P50542 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PEX5P50542 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PEX5P50542 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PEX5P50542 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PEX5P50542 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PEX5P50542 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PEX5P50542 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PEX5P50542 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PEX5P50542 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PEX5P50542 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PEX5P50542 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PEX5P50542 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PEX5P50542 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PEX5P50542 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PEX5P50542 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PEX5P50542 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PEX5P50542 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PEX5P50542 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PEX5P50542 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PEX5P50542 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PEX5P50542 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PEX5P50542 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PEX5P50542 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PEX5P50542 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PEX5P50542 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PEX5P50542 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PEX5P50542 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms