Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRP3P50461 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRP3P50461 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSRP3P50461 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSRP3P50461 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CSRP3P50461 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CSRP3P50461 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CSRP3P50461 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CSRP3P50461 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CSRP3P50461 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSRP3P50461 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSRP3P50461 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CSRP3P50461 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CSRP3P50461 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRP3P50461 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRP3P50461 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRP3P50461 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSRP3P50461 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSRP3P50461 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSRP3P50461 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRP3P50461 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRP3P50461 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRP3P50461 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSRP3P50461 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRP3P50461 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSRP3P50461 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSRP3P50461 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRP3P50461 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRP3P50461 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRP3P50461 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRP3P50461 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRP3P50461 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSRP3P50461 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSRP3P50461 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CSRP3P50461 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSRP3P50461 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSRP3P50461 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSRP3P50461 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CSRP3P50461 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CSRP3P50461 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSRP3P50461 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSRP3P50461 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSRP3P50461 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSRP3P50461 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSRP3P50461 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSRP3P50461 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSRP3P50461 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSRP3P50461 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSRP3P50461 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSRP3P50461 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSRP3P50461 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSRP3P50461 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSRP3P50461 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSRP3P50461 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSRP3P50461 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSRP3P50461 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRP3P50461 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRP3P50461 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRP3P50461 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRP3P50461 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRP3P50461 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRP3P50461 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRP3P50461 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSRP3P50461 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRP3P50461 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSRP3P50461 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSRP3P50461 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CSRP3P50461 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CSRP3P50461 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSRP3P50461 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSRP3P50461 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSRP3P50461 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSRP3P50461 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CSRP3P50461 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRP3P50461 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRP3P50461 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRP3P50461 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSRP3P50461 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSRP3P50461 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSRP3P50461 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSRP3P50461 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSRP3P50461 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRP3P50461 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRP3P50461 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRP3P50461 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRP3P50461 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRP3P50461 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRP3P50461 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRP3P50461 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRP3P50461 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSRP3P50461 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSRP3P50461 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSRP3P50461 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSRP3P50461 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSRP3P50461 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSRP3P50461 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSRP3P50461 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSRP3P50461 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSRP3P50461 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSRP3P50461 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms