Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MRE11P49959 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MRE11P49959 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MRE11P49959 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
MRE11P49959 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
MRE11P49959 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MRE11P49959 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MRE11P49959 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
MRE11P49959 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
MRE11P49959 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.93
MRE11P49959 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MRE11P49959 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MRE11P49959 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
MRE11P49959 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MRE11P49959 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
MRE11P49959 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
MRE11P49959 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
MRE11P49959 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
MRE11P49959 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
MRE11P49959 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
MRE11P49959 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
MRE11P49959 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
MRE11P49959 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
MRE11P49959 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
MRE11P49959 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
MRE11P49959 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MRE11P49959 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MRE11P49959 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
MRE11P49959 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
MRE11P49959 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MRE11P49959 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MRE11P49959 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
MRE11P49959 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
MRE11P49959 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MRE11P49959 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MRE11P49959 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
MRE11P49959 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
MRE11P49959 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
MRE11P49959 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
MRE11P49959 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
MRE11P49959 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
MRE11P49959 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
MRE11P49959 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
MRE11P49959 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
MRE11P49959 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
MRE11P49959 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
MRE11P49959 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
MRE11P49959 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
MRE11P49959 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
MRE11P49959 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MRE11P49959 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
MRE11P49959 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MRE11P49959 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MRE11P49959 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MRE11P49959 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
MRE11P49959 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MRE11P49959 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MRE11P49959 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
MRE11P49959 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
MRE11P49959 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MRE11P49959 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MRE11P49959 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
MRE11P49959 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MRE11P49959 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
MRE11P49959 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
MRE11P49959 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
MRE11P49959 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MRE11P49959 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MRE11P49959 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
MRE11P49959 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MRE11P49959 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
MRE11P49959 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
MRE11P49959 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
MRE11P49959 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
MRE11P49959 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MRE11P49959 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
MRE11P49959 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
MRE11P49959 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MRE11P49959 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
MRE11P49959 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
MRE11P49959 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
MRE11P49959 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
MRE11P49959 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
MRE11P49959 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
MRE11P49959 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MRE11P49959 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MRE11P49959 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MRE11P49959 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MRE11P49959 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
MRE11P49959 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MRE11P49959 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
MRE11P49959 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
MRE11P49959 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MRE11P49959 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
MRE11P49959 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
MRE11P49959 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
MRE11P49959 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
MRE11P49959 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
MRE11P49959 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
MRE11P49959 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms