Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB2P49721 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB2P49721 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB2P49721 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB2P49721 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB2P49721 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMB2P49721 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMB2P49721 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMB2P49721 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMB2P49721 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMB2P49721 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMB2P49721 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB2P49721 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB2P49721 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB2P49721 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB2P49721 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB2P49721 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB2P49721 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB2P49721 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB2P49721 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB2P49721 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB2P49721 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB2P49721 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB2P49721 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB2P49721 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMB2P49721 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMB2P49721 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMB2P49721 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSMB2P49721 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSMB2P49721 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSMB2P49721 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB2P49721 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB2P49721 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB2P49721 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB2P49721 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB2P49721 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB2P49721 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB2P49721 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMB2P49721 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PSMB2P49721 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMB2P49721 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMB2P49721 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMB2P49721 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB2P49721 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB2P49721 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB2P49721 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB2P49721 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB2P49721 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB2P49721 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB2P49721 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB2P49721 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB2P49721 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB2P49721 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB2P49721 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB2P49721 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB2P49721 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB2P49721 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB2P49721 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB2P49721 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB2P49721 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB2P49721 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB2P49721 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB2P49721 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB2P49721 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB2P49721 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB2P49721 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB2P49721 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB2P49721 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB2P49721 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB2P49721 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB2P49721 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB2P49721 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB2P49721 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB2P49721 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB2P49721 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB2P49721 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB2P49721 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMB2P49721 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMB2P49721 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMB2P49721 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMB2P49721 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB2P49721 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB2P49721 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB2P49721 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSMB2P49721 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSMB2P49721 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSMB2P49721 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PSMB2P49721 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PSMB2P49721 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PSMB2P49721 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PSMB2P49721 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSMB2P49721 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB2P49721 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB2P49721 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB2P49721 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB2P49721 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB2P49721 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB2P49721 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB2P49721 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB2P49721 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms