Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RXRGP48443 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RXRGP48443 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RXRGP48443 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RXRGP48443 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RXRGP48443 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RXRGP48443 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RXRGP48443 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RXRGP48443 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RXRGP48443 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RXRGP48443 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RXRGP48443 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RXRGP48443 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RXRGP48443 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RXRGP48443 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RXRGP48443 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RXRGP48443 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RXRGP48443 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RXRGP48443 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RXRGP48443 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RXRGP48443 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RXRGP48443 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RXRGP48443 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RXRGP48443 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RXRGP48443 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RXRGP48443 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RXRGP48443 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RXRGP48443 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RXRGP48443 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RXRGP48443 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RXRGP48443 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RXRGP48443 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RXRGP48443 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RXRGP48443 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RXRGP48443 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RXRGP48443 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RXRGP48443 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RXRGP48443 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RXRGP48443 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RXRGP48443 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RXRGP48443 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RXRGP48443 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RXRGP48443 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RXRGP48443 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RXRGP48443 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RXRGP48443 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RXRGP48443 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RXRGP48443 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RXRGP48443 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RXRGP48443 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RXRGP48443 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RXRGP48443 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RXRGP48443 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RXRGP48443 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RXRGP48443 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RXRGP48443 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RXRGP48443 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RXRGP48443 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RXRGP48443 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RXRGP48443 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RXRGP48443 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RXRGP48443 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RXRGP48443 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RXRGP48443 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RXRGP48443 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RXRGP48443 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RXRGP48443 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RXRGP48443 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RXRGP48443 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RXRGP48443 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RXRGP48443 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RXRGP48443 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RXRGP48443 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RXRGP48443 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RXRGP48443 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RXRGP48443 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RXRGP48443 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RXRGP48443 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RXRGP48443 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RXRGP48443 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RXRGP48443 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RXRGP48443 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RXRGP48443 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RXRGP48443 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RXRGP48443 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RXRGP48443 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RXRGP48443 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RXRGP48443 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RXRGP48443 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RXRGP48443 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RXRGP48443 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RXRGP48443 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RXRGP48443 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RXRGP48443 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RXRGP48443 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RXRGP48443 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RXRGP48443 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RXRGP48443 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RXRGP48443 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RXRGP48443 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms