Protein–RNA interactions for Protein: P48378

RFX2, DNA-binding protein RFX2, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX2P48378 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFX2P48378 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX2P48378 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFX2P48378 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFX2P48378 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFX2P48378 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFX2P48378 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFX2P48378 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFX2P48378 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX2P48378 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX2P48378 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX2P48378 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFX2P48378 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFX2P48378 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFX2P48378 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFX2P48378 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX2P48378 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFX2P48378 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFX2P48378 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFX2P48378 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFX2P48378 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFX2P48378 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFX2P48378 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFX2P48378 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFX2P48378 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFX2P48378 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFX2P48378 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFX2P48378 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFX2P48378 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFX2P48378 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFX2P48378 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFX2P48378 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFX2P48378 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX2P48378 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFX2P48378 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFX2P48378 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX2P48378 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX2P48378 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX2P48378 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX2P48378 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX2P48378 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX2P48378 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX2P48378 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX2P48378 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX2P48378 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX2P48378 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX2P48378 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX2P48378 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX2P48378 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX2P48378 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX2P48378 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RFX2P48378 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFX2P48378 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX2P48378 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX2P48378 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX2P48378 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX2P48378 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX2P48378 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX2P48378 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX2P48378 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX2P48378 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX2P48378 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX2P48378 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX2P48378 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX2P48378 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX2P48378 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX2P48378 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX2P48378 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX2P48378 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX2P48378 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX2P48378 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFX2P48378 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFX2P48378 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFX2P48378 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX2P48378 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFX2P48378 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFX2P48378 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX2P48378 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX2P48378 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFX2P48378 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX2P48378 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX2P48378 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFX2P48378 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX2P48378 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX2P48378 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX2P48378 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX2P48378 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX2P48378 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX2P48378 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX2P48378 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX2P48378 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX2P48378 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX2P48378 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX2P48378 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX2P48378 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX2P48378 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX2P48378 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX2P48378 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFX2P48378 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFX2P48378 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms