Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GJA8P48165 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GJA8P48165 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GJA8P48165 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GJA8P48165 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
GJA8P48165 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GJA8P48165 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
GJA8P48165 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GJA8P48165 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GJA8P48165 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GJA8P48165 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GJA8P48165 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
GJA8P48165 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
GJA8P48165 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
GJA8P48165 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GJA8P48165 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GJA8P48165 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GJA8P48165 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
GJA8P48165 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
GJA8P48165 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GJA8P48165 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GJA8P48165 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
GJA8P48165 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GJA8P48165 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GJA8P48165 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GJA8P48165 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
GJA8P48165 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GJA8P48165 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
GJA8P48165 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
GJA8P48165 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
GJA8P48165 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
GJA8P48165 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
GJA8P48165 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GJA8P48165 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
GJA8P48165 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GJA8P48165 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GJA8P48165 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GJA8P48165 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GJA8P48165 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GJA8P48165 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GJA8P48165 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GJA8P48165 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GJA8P48165 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GJA8P48165 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
GJA8P48165 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GJA8P48165 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
GJA8P48165 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GJA8P48165 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GJA8P48165 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GJA8P48165 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GJA8P48165 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
GJA8P48165 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GJA8P48165 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GJA8P48165 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GJA8P48165 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GJA8P48165 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
GJA8P48165 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GJA8P48165 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GJA8P48165 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GJA8P48165 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GJA8P48165 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GJA8P48165 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GJA8P48165 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GJA8P48165 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GJA8P48165 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GJA8P48165 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
GJA8P48165 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GJA8P48165 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
GJA8P48165 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GJA8P48165 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GJA8P48165 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GJA8P48165 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GJA8P48165 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GJA8P48165 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
GJA8P48165 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GJA8P48165 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GJA8P48165 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GJA8P48165 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GJA8P48165 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GJA8P48165 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
GJA8P48165 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GJA8P48165 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GJA8P48165 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GJA8P48165 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GJA8P48165 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GJA8P48165 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
GJA8P48165 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GJA8P48165 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GJA8P48165 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GJA8P48165 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
GJA8P48165 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GJA8P48165 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GJA8P48165 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GJA8P48165 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GJA8P48165 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GJA8P48165 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GJA8P48165 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GJA8P48165 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GJA8P48165 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GJA8P48165 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms