Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASP2P42575 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASP2P42575 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASP2P42575 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CASP2P42575 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CASP2P42575 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CASP2P42575 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASP2P42575 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASP2P42575 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASP2P42575 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASP2P42575 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASP2P42575 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP2P42575 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP2P42575 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP2P42575 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASP2P42575 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASP2P42575 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP2P42575 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP2P42575 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP2P42575 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP2P42575 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP2P42575 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP2P42575 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP2P42575 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP2P42575 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP2P42575 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP2P42575 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP2P42575 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP2P42575 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP2P42575 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP2P42575 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASP2P42575 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASP2P42575 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASP2P42575 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CASP2P42575 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CASP2P42575 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASP2P42575 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASP2P42575 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CASP2P42575 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASP2P42575 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP2P42575 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP2P42575 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASP2P42575 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CASP2P42575 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP2P42575 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP2P42575 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASP2P42575 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CASP2P42575 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP2P42575 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP2P42575 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP2P42575 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASP2P42575 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASP2P42575 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASP2P42575 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP2P42575 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP2P42575 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP2P42575 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP2P42575 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASP2P42575 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP2P42575 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP2P42575 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP2P42575 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASP2P42575 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP2P42575 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP2P42575 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP2P42575 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP2P42575 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP2P42575 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASP2P42575 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASP2P42575 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP2P42575 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP2P42575 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASP2P42575 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASP2P42575 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP2P42575 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASP2P42575 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP2P42575 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP2P42575 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASP2P42575 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CASP2P42575 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CASP2P42575 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP2P42575 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASP2P42575 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASP2P42575 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP2P42575 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASP2P42575 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASP2P42575 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP2P42575 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP2P42575 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP2P42575 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP2P42575 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASP2P42575 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASP2P42575 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP2P42575 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP2P42575 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASP2P42575 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CASP2P42575 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP2P42575 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP2P42575 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP2P42575 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms