Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARL1P40616 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARL1P40616 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARL1P40616 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARL1P40616 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARL1P40616 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARL1P40616 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARL1P40616 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARL1P40616 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARL1P40616 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARL1P40616 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARL1P40616 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARL1P40616 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARL1P40616 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARL1P40616 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARL1P40616 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARL1P40616 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARL1P40616 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARL1P40616 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARL1P40616 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARL1P40616 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARL1P40616 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARL1P40616 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARL1P40616 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARL1P40616 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARL1P40616 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARL1P40616 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARL1P40616 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARL1P40616 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARL1P40616 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARL1P40616 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARL1P40616 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARL1P40616 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARL1P40616 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARL1P40616 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARL1P40616 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARL1P40616 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARL1P40616 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARL1P40616 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARL1P40616 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARL1P40616 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARL1P40616 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARL1P40616 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARL1P40616 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARL1P40616 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
ARL1P40616 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ARL1P40616 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ARL1P40616 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARL1P40616 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ARL1P40616 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARL1P40616 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARL1P40616 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARL1P40616 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ARL1P40616 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARL1P40616 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARL1P40616 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARL1P40616 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARL1P40616 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARL1P40616 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARL1P40616 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARL1P40616 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARL1P40616 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARL1P40616 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARL1P40616 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARL1P40616 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARL1P40616 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARL1P40616 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARL1P40616 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARL1P40616 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARL1P40616 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARL1P40616 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARL1P40616 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARL1P40616 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARL1P40616 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARL1P40616 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARL1P40616 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARL1P40616 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARL1P40616 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARL1P40616 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ARL1P40616 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARL1P40616 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARL1P40616 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARL1P40616 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARL1P40616 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARL1P40616 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARL1P40616 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARL1P40616 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARL1P40616 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARL1P40616 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARL1P40616 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARL1P40616 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARL1P40616 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARL1P40616 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARL1P40616 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARL1P40616 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARL1P40616 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARL1P40616 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARL1P40616 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARL1P40616 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARL1P40616 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms