Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPL4P36578 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPL4P36578 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPL4P36578 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPL4P36578 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL4P36578 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL4P36578 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPL4P36578 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPL4P36578 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPL4P36578 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPL4P36578 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPL4P36578 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPL4P36578 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPL4P36578 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPL4P36578 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPL4P36578 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL4P36578 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL4P36578 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL4P36578 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL4P36578 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPL4P36578 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPL4P36578 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPL4P36578 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPL4P36578 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPL4P36578 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPL4P36578 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPL4P36578 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPL4P36578 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPL4P36578 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPL4P36578 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPL4P36578 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPL4P36578 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPL4P36578 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPL4P36578 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPL4P36578 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPL4P36578 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPL4P36578 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPL4P36578 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPL4P36578 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPL4P36578 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL4P36578 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL4P36578 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL4P36578 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL4P36578 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL4P36578 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL4P36578 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RPL4P36578 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL4P36578 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL4P36578 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL4P36578 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL4P36578 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPL4P36578 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPL4P36578 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL4P36578 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL4P36578 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL4P36578 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL4P36578 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPL4P36578 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL4P36578 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL4P36578 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL4P36578 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL4P36578 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL4P36578 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL4P36578 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RPL4P36578 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL4P36578 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL4P36578 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL4P36578 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL4P36578 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL4P36578 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL4P36578 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL4P36578 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL4P36578 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL4P36578 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL4P36578 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL4P36578 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL4P36578 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL4P36578 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPL4P36578 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL4P36578 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL4P36578 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL4P36578 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL4P36578 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL4P36578 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL4P36578 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL4P36578 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL4P36578 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL4P36578 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL4P36578 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL4P36578 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL4P36578 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL4P36578 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL4P36578 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL4P36578 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL4P36578 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPL4P36578 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPL4P36578 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPL4P36578 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL4P36578 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL4P36578 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms