Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP214P35658 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP214P35658 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP214P35658 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP214P35658 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP214P35658 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP214P35658 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP214P35658 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP214P35658 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP214P35658 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP214P35658 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP214P35658 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP214P35658 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP214P35658 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP214P35658 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP214P35658 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NUP214P35658 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NUP214P35658 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP214P35658 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP214P35658 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP214P35658 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP214P35658 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP214P35658 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP214P35658 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP214P35658 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP214P35658 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP214P35658 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NUP214P35658 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP214P35658 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP214P35658 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP214P35658 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP214P35658 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP214P35658 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP214P35658 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP214P35658 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP214P35658 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP214P35658 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP214P35658 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP214P35658 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP214P35658 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NUP214P35658 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUP214P35658 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP214P35658 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP214P35658 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP214P35658 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NUP214P35658 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP214P35658 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP214P35658 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP214P35658 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP214P35658 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP214P35658 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP214P35658 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP214P35658 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP214P35658 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP214P35658 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP214P35658 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP214P35658 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP214P35658 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP214P35658 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP214P35658 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP214P35658 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP214P35658 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP214P35658 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP214P35658 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP214P35658 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP214P35658 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP214P35658 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP214P35658 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP214P35658 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP214P35658 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP214P35658 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP214P35658 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP214P35658 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP214P35658 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP214P35658 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP214P35658 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP214P35658 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP214P35658 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP214P35658 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP214P35658 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP214P35658 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP214P35658 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP214P35658 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP214P35658 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP214P35658 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NUP214P35658 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NUP214P35658 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NUP214P35658 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP214P35658 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP214P35658 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP214P35658 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP214P35658 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP214P35658 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP214P35658 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP214P35658 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP214P35658 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP214P35658 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP214P35658 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP214P35658 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP214P35658 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms