Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRS3P32247 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRS3P32247 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRS3P32247 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
BRS3P32247 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRS3P32247 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRS3P32247 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRS3P32247 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRS3P32247 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRS3P32247 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRS3P32247 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BRS3P32247 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRS3P32247 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRS3P32247 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRS3P32247 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRS3P32247 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRS3P32247 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRS3P32247 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRS3P32247 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRS3P32247 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRS3P32247 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRS3P32247 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRS3P32247 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRS3P32247 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRS3P32247 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRS3P32247 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRS3P32247 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRS3P32247 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRS3P32247 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRS3P32247 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRS3P32247 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRS3P32247 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BRS3P32247 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRS3P32247 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRS3P32247 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRS3P32247 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRS3P32247 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRS3P32247 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRS3P32247 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRS3P32247 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRS3P32247 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRS3P32247 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRS3P32247 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRS3P32247 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRS3P32247 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRS3P32247 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRS3P32247 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRS3P32247 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRS3P32247 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRS3P32247 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BRS3P32247 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRS3P32247 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRS3P32247 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRS3P32247 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRS3P32247 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRS3P32247 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRS3P32247 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRS3P32247 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRS3P32247 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRS3P32247 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRS3P32247 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRS3P32247 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRS3P32247 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRS3P32247 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRS3P32247 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRS3P32247 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRS3P32247 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRS3P32247 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRS3P32247 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRS3P32247 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRS3P32247 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRS3P32247 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRS3P32247 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRS3P32247 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRS3P32247 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRS3P32247 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRS3P32247 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRS3P32247 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRS3P32247 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRS3P32247 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRS3P32247 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRS3P32247 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRS3P32247 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRS3P32247 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRS3P32247 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRS3P32247 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRS3P32247 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRS3P32247 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRS3P32247 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRS3P32247 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRS3P32247 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRS3P32247 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRS3P32247 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRS3P32247 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRS3P32247 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRS3P32247 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRS3P32247 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRS3P32247 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRS3P32247 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRS3P32247 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms