Protein–RNA interactions for Protein: P29590

PML, Protein PML, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMLP29590 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PMLP29590 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PMLP29590 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PMLP29590 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PMLP29590 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PMLP29590 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PMLP29590 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PMLP29590 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PMLP29590 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PMLP29590 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PMLP29590 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PMLP29590 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PMLP29590 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PMLP29590 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PMLP29590 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PMLP29590 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PMLP29590 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PMLP29590 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PMLP29590 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PMLP29590 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PMLP29590 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PMLP29590 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PMLP29590 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PMLP29590 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PMLP29590 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PMLP29590 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PMLP29590 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PMLP29590 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PMLP29590 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PMLP29590 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PMLP29590 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PMLP29590 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PMLP29590 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PMLP29590 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PMLP29590 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PMLP29590 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PMLP29590 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PMLP29590 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PMLP29590 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PMLP29590 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PMLP29590 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PMLP29590 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PMLP29590 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PMLP29590 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PMLP29590 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PMLP29590 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PMLP29590 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PMLP29590 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PMLP29590 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PMLP29590 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PMLP29590 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PMLP29590 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PMLP29590 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PMLP29590 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PMLP29590 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PMLP29590 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PMLP29590 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PMLP29590 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PMLP29590 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PMLP29590 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PMLP29590 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PMLP29590 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PMLP29590 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PMLP29590 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PMLP29590 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PMLP29590 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PMLP29590 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PMLP29590 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PMLP29590 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PMLP29590 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PMLP29590 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PMLP29590 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PMLP29590 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PMLP29590 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PMLP29590 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PMLP29590 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PMLP29590 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PMLP29590 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PMLP29590 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PMLP29590 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PMLP29590 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PMLP29590 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PMLP29590 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PMLP29590 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PMLP29590 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PMLP29590 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PMLP29590 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PMLP29590 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PMLP29590 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PMLP29590 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PMLP29590 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PMLP29590 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PMLP29590 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PMLP29590 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PMLP29590 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PMLP29590 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PMLP29590 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PMLP29590 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PMLP29590 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PMLP29590 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms