Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NMBRP28336 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NMBRP28336 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NMBRP28336 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NMBRP28336 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NMBRP28336 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NMBRP28336 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NMBRP28336 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NMBRP28336 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NMBRP28336 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NMBRP28336 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NMBRP28336 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NMBRP28336 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NMBRP28336 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NMBRP28336 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NMBRP28336 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NMBRP28336 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NMBRP28336 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NMBRP28336 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NMBRP28336 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NMBRP28336 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NMBRP28336 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NMBRP28336 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NMBRP28336 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NMBRP28336 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NMBRP28336 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NMBRP28336 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NMBRP28336 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NMBRP28336 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NMBRP28336 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NMBRP28336 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NMBRP28336 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NMBRP28336 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NMBRP28336 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NMBRP28336 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NMBRP28336 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NMBRP28336 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NMBRP28336 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NMBRP28336 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NMBRP28336 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NMBRP28336 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NMBRP28336 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NMBRP28336 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NMBRP28336 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NMBRP28336 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NMBRP28336 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NMBRP28336 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NMBRP28336 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NMBRP28336 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NMBRP28336 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NMBRP28336 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NMBRP28336 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NMBRP28336 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NMBRP28336 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NMBRP28336 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NMBRP28336 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NMBRP28336 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NMBRP28336 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NMBRP28336 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NMBRP28336 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NMBRP28336 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NMBRP28336 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NMBRP28336 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NMBRP28336 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NMBRP28336 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NMBRP28336 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NMBRP28336 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NMBRP28336 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NMBRP28336 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NMBRP28336 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NMBRP28336 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NMBRP28336 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NMBRP28336 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NMBRP28336 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NMBRP28336 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NMBRP28336 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NMBRP28336 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NMBRP28336 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NMBRP28336 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NMBRP28336 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NMBRP28336 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NMBRP28336 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NMBRP28336 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NMBRP28336 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NMBRP28336 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NMBRP28336 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NMBRP28336 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NMBRP28336 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NMBRP28336 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NMBRP28336 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
NMBRP28336 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NMBRP28336 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NMBRP28336 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NMBRP28336 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NMBRP28336 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NMBRP28336 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NMBRP28336 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NMBRP28336 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NMBRP28336 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NMBRP28336 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms