Protein–RNA interactions for Protein: P28062

PSMB8, Proteasome subunit beta type-8, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB8P28062 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB8P28062 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB8P28062 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB8P28062 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB8P28062 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB8P28062 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB8P28062 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB8P28062 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMB8P28062 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB8P28062 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB8P28062 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB8P28062 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB8P28062 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB8P28062 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB8P28062 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB8P28062 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB8P28062 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB8P28062 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB8P28062 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB8P28062 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB8P28062 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB8P28062 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB8P28062 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB8P28062 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB8P28062 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB8P28062 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB8P28062 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB8P28062 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB8P28062 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB8P28062 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB8P28062 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMB8P28062 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMB8P28062 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB8P28062 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB8P28062 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB8P28062 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB8P28062 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB8P28062 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB8P28062 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB8P28062 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB8P28062 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB8P28062 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB8P28062 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB8P28062 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB8P28062 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB8P28062 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB8P28062 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB8P28062 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB8P28062 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB8P28062 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB8P28062 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB8P28062 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB8P28062 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB8P28062 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB8P28062 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB8P28062 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB8P28062 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB8P28062 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB8P28062 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB8P28062 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB8P28062 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB8P28062 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB8P28062 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB8P28062 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB8P28062 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB8P28062 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB8P28062 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB8P28062 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB8P28062 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB8P28062 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB8P28062 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB8P28062 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB8P28062 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB8P28062 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMB8P28062 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB8P28062 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB8P28062 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB8P28062 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB8P28062 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB8P28062 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB8P28062 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB8P28062 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB8P28062 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB8P28062 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB8P28062 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB8P28062 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB8P28062 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB8P28062 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB8P28062 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB8P28062 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB8P28062 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB8P28062 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB8P28062 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB8P28062 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB8P28062 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB8P28062 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB8P28062 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB8P28062 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB8P28062 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB8P28062 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms