Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCEA1P23193 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCEA1P23193 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TCEA1P23193 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCEA1P23193 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCEA1P23193 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCEA1P23193 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCEA1P23193 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCEA1P23193 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCEA1P23193 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCEA1P23193 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCEA1P23193 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCEA1P23193 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCEA1P23193 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCEA1P23193 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCEA1P23193 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCEA1P23193 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCEA1P23193 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCEA1P23193 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCEA1P23193 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCEA1P23193 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCEA1P23193 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCEA1P23193 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCEA1P23193 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCEA1P23193 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCEA1P23193 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TCEA1P23193 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCEA1P23193 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TCEA1P23193 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCEA1P23193 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCEA1P23193 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCEA1P23193 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCEA1P23193 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCEA1P23193 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCEA1P23193 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCEA1P23193 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCEA1P23193 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCEA1P23193 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCEA1P23193 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCEA1P23193 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCEA1P23193 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TCEA1P23193 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TCEA1P23193 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCEA1P23193 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCEA1P23193 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCEA1P23193 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCEA1P23193 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCEA1P23193 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCEA1P23193 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCEA1P23193 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCEA1P23193 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCEA1P23193 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCEA1P23193 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCEA1P23193 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCEA1P23193 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCEA1P23193 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCEA1P23193 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCEA1P23193 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCEA1P23193 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TCEA1P23193 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCEA1P23193 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCEA1P23193 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCEA1P23193 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCEA1P23193 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCEA1P23193 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCEA1P23193 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCEA1P23193 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCEA1P23193 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCEA1P23193 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCEA1P23193 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCEA1P23193 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCEA1P23193 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TCEA1P23193 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCEA1P23193 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCEA1P23193 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCEA1P23193 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCEA1P23193 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCEA1P23193 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCEA1P23193 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCEA1P23193 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCEA1P23193 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCEA1P23193 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCEA1P23193 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCEA1P23193 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCEA1P23193 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCEA1P23193 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCEA1P23193 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TCEA1P23193 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCEA1P23193 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCEA1P23193 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCEA1P23193 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCEA1P23193 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCEA1P23193 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCEA1P23193 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCEA1P23193 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCEA1P23193 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCEA1P23193 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCEA1P23193 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCEA1P23193 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCEA1P23193 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms