Protein–RNA interactions for Protein: P22459

KCNA4, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA4P22459 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KCNA4P22459 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KCNA4P22459 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
KCNA4P22459 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KCNA4P22459 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KCNA4P22459 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KCNA4P22459 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KCNA4P22459 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KCNA4P22459 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KCNA4P22459 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNA4P22459 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNA4P22459 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNA4P22459 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNA4P22459 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNA4P22459 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNA4P22459 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNA4P22459 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNA4P22459 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNA4P22459 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNA4P22459 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNA4P22459 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNA4P22459 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNA4P22459 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNA4P22459 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNA4P22459 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNA4P22459 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNA4P22459 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNA4P22459 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNA4P22459 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNA4P22459 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNA4P22459 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KCNA4P22459 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KCNA4P22459 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KCNA4P22459 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KCNA4P22459 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KCNA4P22459 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNA4P22459 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNA4P22459 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNA4P22459 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNA4P22459 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNA4P22459 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNA4P22459 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KCNA4P22459 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNA4P22459 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNA4P22459 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNA4P22459 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNA4P22459 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNA4P22459 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KCNA4P22459 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNA4P22459 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNA4P22459 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNA4P22459 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNA4P22459 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNA4P22459 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCNA4P22459 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNA4P22459 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNA4P22459 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNA4P22459 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNA4P22459 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNA4P22459 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNA4P22459 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNA4P22459 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNA4P22459 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNA4P22459 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNA4P22459 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNA4P22459 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNA4P22459 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNA4P22459 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNA4P22459 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNA4P22459 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNA4P22459 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNA4P22459 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNA4P22459 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KCNA4P22459 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNA4P22459 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNA4P22459 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNA4P22459 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNA4P22459 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNA4P22459 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNA4P22459 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNA4P22459 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNA4P22459 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNA4P22459 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNA4P22459 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNA4P22459 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNA4P22459 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNA4P22459 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNA4P22459 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNA4P22459 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNA4P22459 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNA4P22459 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNA4P22459 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNA4P22459 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNA4P22459 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNA4P22459 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNA4P22459 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
KCNA4P22459 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNA4P22459 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNA4P22459 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNA4P22459 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms