Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTF3P20783 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTF3P20783 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTF3P20783 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTF3P20783 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTF3P20783 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTF3P20783 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTF3P20783 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTF3P20783 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTF3P20783 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTF3P20783 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTF3P20783 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTF3P20783 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTF3P20783 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTF3P20783 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTF3P20783 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTF3P20783 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTF3P20783 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTF3P20783 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTF3P20783 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTF3P20783 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTF3P20783 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTF3P20783 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTF3P20783 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTF3P20783 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTF3P20783 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTF3P20783 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTF3P20783 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTF3P20783 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTF3P20783 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTF3P20783 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTF3P20783 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTF3P20783 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTF3P20783 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTF3P20783 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTF3P20783 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTF3P20783 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTF3P20783 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NTF3P20783 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NTF3P20783 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTF3P20783 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTF3P20783 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTF3P20783 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTF3P20783 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTF3P20783 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NTF3P20783 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NTF3P20783 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NTF3P20783 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTF3P20783 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTF3P20783 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NTF3P20783 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NTF3P20783 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NTF3P20783 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NTF3P20783 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NTF3P20783 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NTF3P20783 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NTF3P20783 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NTF3P20783 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTF3P20783 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTF3P20783 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTF3P20783 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTF3P20783 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTF3P20783 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTF3P20783 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTF3P20783 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTF3P20783 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NTF3P20783 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTF3P20783 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTF3P20783 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTF3P20783 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTF3P20783 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NTF3P20783 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTF3P20783 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NTF3P20783 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTF3P20783 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTF3P20783 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTF3P20783 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTF3P20783 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTF3P20783 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTF3P20783 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTF3P20783 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTF3P20783 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTF3P20783 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NTF3P20783 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTF3P20783 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NTF3P20783 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTF3P20783 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTF3P20783 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTF3P20783 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTF3P20783 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTF3P20783 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTF3P20783 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTF3P20783 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NTF3P20783 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTF3P20783 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTF3P20783 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTF3P20783 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTF3P20783 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTF3P20783 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTF3P20783 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms