Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
LMNB1P20700 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
LMNB1P20700 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
LMNB1P20700 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
LMNB1P20700 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
LMNB1P20700 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
LMNB1P20700 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
LMNB1P20700 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
LMNB1P20700 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
LMNB1P20700 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
LMNB1P20700 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
LMNB1P20700 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
LMNB1P20700 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
LMNB1P20700 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
LMNB1P20700 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
LMNB1P20700 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
LMNB1P20700 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.19■■■■□ 3.38
LMNB1P20700 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
LMNB1P20700 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
LMNB1P20700 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
LMNB1P20700 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
LMNB1P20700 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
LMNB1P20700 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
LMNB1P20700 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
LMNB1P20700 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
LMNB1P20700 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LMNB1P20700 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LMNB1P20700 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LMNB1P20700 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
LMNB1P20700 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
LMNB1P20700 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
LMNB1P20700 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
LMNB1P20700 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
LMNB1P20700 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
LMNB1P20700 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
LMNB1P20700 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
LMNB1P20700 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
LMNB1P20700 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
LMNB1P20700 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
LMNB1P20700 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
LMNB1P20700 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
LMNB1P20700 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
LMNB1P20700 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
LMNB1P20700 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
LMNB1P20700 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
LMNB1P20700 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
LMNB1P20700 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
LMNB1P20700 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
LMNB1P20700 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
LMNB1P20700 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
LMNB1P20700 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
LMNB1P20700 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
LMNB1P20700 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
LMNB1P20700 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
LMNB1P20700 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
LMNB1P20700 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
LMNB1P20700 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
LMNB1P20700 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
LMNB1P20700 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
LMNB1P20700 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LMNB1P20700 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
LMNB1P20700 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
LMNB1P20700 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
LMNB1P20700 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LMNB1P20700 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
LMNB1P20700 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
LMNB1P20700 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
LMNB1P20700 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
LMNB1P20700 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
LMNB1P20700 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
LMNB1P20700 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
LMNB1P20700 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
LMNB1P20700 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
LMNB1P20700 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
LMNB1P20700 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
LMNB1P20700 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
LMNB1P20700 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
LMNB1P20700 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
LMNB1P20700 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
LMNB1P20700 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.22■■■■□ 3.23
LMNB1P20700 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LMNB1P20700 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
LMNB1P20700 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LMNB1P20700 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LMNB1P20700 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
LMNB1P20700 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
LMNB1P20700 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
LMNB1P20700 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
LMNB1P20700 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
LMNB1P20700 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
LMNB1P20700 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
LMNB1P20700 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
LMNB1P20700 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
LMNB1P20700 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
LMNB1P20700 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
LMNB1P20700 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
LMNB1P20700 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
LMNB1P20700 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
LMNB1P20700 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
LMNB1P20700 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms