Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PVALBP20472 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PVALBP20472 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PVALBP20472 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PVALBP20472 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PVALBP20472 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PVALBP20472 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PVALBP20472 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PVALBP20472 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PVALBP20472 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PVALBP20472 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PVALBP20472 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PVALBP20472 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PVALBP20472 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PVALBP20472 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PVALBP20472 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PVALBP20472 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PVALBP20472 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PVALBP20472 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PVALBP20472 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PVALBP20472 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PVALBP20472 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PVALBP20472 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PVALBP20472 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PVALBP20472 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PVALBP20472 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PVALBP20472 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PVALBP20472 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PVALBP20472 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PVALBP20472 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PVALBP20472 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PVALBP20472 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PVALBP20472 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PVALBP20472 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PVALBP20472 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PVALBP20472 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PVALBP20472 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PVALBP20472 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PVALBP20472 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PVALBP20472 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PVALBP20472 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PVALBP20472 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PVALBP20472 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PVALBP20472 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PVALBP20472 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PVALBP20472 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PVALBP20472 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PVALBP20472 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PVALBP20472 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PVALBP20472 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PVALBP20472 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PVALBP20472 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PVALBP20472 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PVALBP20472 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PVALBP20472 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PVALBP20472 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PVALBP20472 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PVALBP20472 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PVALBP20472 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PVALBP20472 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PVALBP20472 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PVALBP20472 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PVALBP20472 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PVALBP20472 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PVALBP20472 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PVALBP20472 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PVALBP20472 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PVALBP20472 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PVALBP20472 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PVALBP20472 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PVALBP20472 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PVALBP20472 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PVALBP20472 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PVALBP20472 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PVALBP20472 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PVALBP20472 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PVALBP20472 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PVALBP20472 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PVALBP20472 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PVALBP20472 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PVALBP20472 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PVALBP20472 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PVALBP20472 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PVALBP20472 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PVALBP20472 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PVALBP20472 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PVALBP20472 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PVALBP20472 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PVALBP20472 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PVALBP20472 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PVALBP20472 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PVALBP20472 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PVALBP20472 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PVALBP20472 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PVALBP20472 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PVALBP20472 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PVALBP20472 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PVALBP20472 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PVALBP20472 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PVALBP20472 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms